脊索瘤与脊索表达数据
数据包含脊索瘤与脊索组织的表达数据,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL570平台及9606物种。该数据可用于脊索瘤与正常脊索组织的表达差异分析及相关研究(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
脊索瘤与脊索表达数据
GSE205458 是一个围绕脊索瘤与脊索组织基因表达特征构建的公开数据集,英文全称为 “Expression data from chordoma and notochord”,在本地分类中归入肿瘤 / 脊索瘤方向。该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),由作者 Stefan、Halvorsen 提交,发布时间为 Jun 03 202。数据集以高通量测序表达谱分析为核心主题,主题标签涵盖 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL570 平台以及物种编号 9606,整体以 SuperSeries 形式组织,其下由若干 SubSeries 组成。数据集当前提供 1 个文件,样例文件名为 GSE205458_series_matrix.txt.gz,可为脊索瘤与脊索组织之间的表达差异分析及相关研究提供数据基础。
【数据集背景】
脊索瘤是一种起源于脊索残余组织的肿瘤,其发生发展与正常脊索组织之间存在密切的生物学联系。围绕脊索瘤与脊索组织开展表达谱研究,有助于从转录层面观察两类组织之间的表达特征差异。GSE205458 正是以“来自脊索瘤与脊索组织的表达数据”为主题构建的数据集,源站标题为 “Expression data from chordoma and notochord”,在本地分类体系中归属于肿瘤 / 脊索瘤方向。该数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述说明其由下方列出的若干 SubSeries 组成,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL570 平台及物种 9606,体现了其在表达谱研究中的定位。
【数据内容】
数据集当前包含 1 个文件,文件样例为 GSE205458_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。从主题标签看,数据内容属于表达谱分析范畴,涉及高通量测序表达谱分析、GPL570 平台以及物种编号 9606。数据集以 SuperSeries 形式组织,源站描述指出该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。除上述文件与标签信息外,源站未提供关于样本数量、分组构成、基因数量或具体表达矩阵字段的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为 “Expression data from chordoma and notochord”,作者为 Stefan、Halvorsen,发布时间为 Jun 03 202。数据集英文名为 GSE205458: Expression data from chordoma and notochord。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及具体实验流程,源站未提供。
【适用场景】
依据数据主题与标签,该数据集可用于脊索瘤与正常脊索组织之间的表达差异分析及相关研究,也可服务于高通量测序表达谱分析方向的方法学探索。主题标签中的 GPL570 平台与物种编号 9606 提示其分析对象为人类表达谱数据。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE205458_series_matrix.txt.gz,并按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以降低因字段理解偏差或编码不一致带来的分析风险。关于表达矩阵的具体字段含义、归一化方式及配套分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
数据集当前仅提供 1 个文件,文件样例为 GSE205458_series_matrix.txt.gz。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供样本量、重复数、批次信息、质控指标或数据完整性说明。发布时间记录为 Jun 03 202,年份信息不完整。关于数据质量评价与使用限制的更多细节,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Stefan、Halvorsen,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为 GSE205458: Expression data from chordoma and notochord。关于引用格式、许可条款及使用条件,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205458
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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