Duke-UNC-Texas-EBI ENCODE 表达项目数据集
该数据集来自 Duke-UNC-Texas-EBI ENCODE 联盟,包含多种细胞类型的基因表达谱数据,并计划与全基因组开放染色质方法(DNase-seq、FAIRE-seq 和 ChIP-seq)的结果进行比较

基本信息
资源简介
Duke-UNC-Texas-EBI ENCODE 表达项目数据集
Duke-UNC-Texas-EBI ENCODE expression project
该数据集来自 Duke-UNC-Texas-EBI ENCODE 联盟,包含多种细胞类型的基因表达谱数据,并计划与全基因组开放染色质方法(DNase-seq、FAIRE-seq 和 ChIP-seq)的结果进行比较。数据集仅含一个文件 GSE15805_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及表达谱芯片和人类(9606)。可用于研究不同细胞类型的表达特征及其与染色质开放状态的关系,并可能服务于肿瘤(脊索瘤)相关分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 23 200。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):这些样本正由 Duke-UNC-Texas-EBI ENCODE 联盟进行分析。这些细胞类型的表达将与三种全基因组开放染色质方法进行比较:DNaseI 超敏性(DNase-seq)、甲醛辅助分离调控元件(FAIRE-seq)和染色质免疫沉淀(ChIP-seq)。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL15997、9606。本站分类:肿瘤/脊索瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE15805
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 25 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE15805
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
这些样本正由Duke-UNC-Texas-EBI ENCODE联盟进行分析。这些细胞类型的表达将与三种全基因组开放染色质方法进行比较:DNaseI超敏感性(DNase-seq)、甲醛辅助分离调控元件(FAIRE-seq)和染色质免疫沉淀(ChIP-seq)。关于数据使用条款和条件,请参阅http://www.genome.gov/27528022 和 http://www.genome.gov/Pages/Research/ENCODE/ENCODEDataReleasePolicyFinal2008.pdf
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