CD133+CD15+脊索瘤干细胞与CD133-CD15-脊索瘤细胞的miRNA和mRNA表达数据

资源简介

CD133+CD15+脊索瘤干细胞与CD133-CD15-脊索瘤细胞的miRNA和mRNA表达数据

GSE109950 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集，主题为脊索瘤（chordoma）中 CD133+CD15+ 细胞与 CD133-CD15- 细胞的 miRNA 和 mRNA 表达谱比较。该数据集以芯片（Expression profiling by array）方式获取表达数据，物种为人类（9606），芯片平台为 GPL17692。数据集由 Emre Can、Tüysüz 提交，发布时间为 2019 年 1 月 31 日，归类于肿瘤 / 脊索瘤方向。数据集以 SuperSeries 形式组织，由若干 SubSeries 组成，当前提供 1 个文件，样例文件名为 GSE109950_series_matrix.txt.gz，内容为压缩后的表达矩阵。该数据集可用于比较脊索瘤中不同表面标志物表型细胞之间的 miRNA 与 mRNA 表达差异。

【数据集背景】

脊索瘤是一种起源于脊索残余组织的肿瘤。该数据集关注脊索瘤细胞中 CD133+CD15+ 表型与 CD133-CD15- 表型之间的表达差异，源站标题将 CD133+CD15+ 脊索瘤细胞标注为脊索瘤癌干细胞（Chordoma Cance Stem Cells，原文如此拼写）。数据集通过同时测定 miRNA 和 mRNA 两类表达谱，为研究这两类细胞群体在转录本层面的差异提供数据基础。数据集所属分类为肿瘤 / 脊索瘤，主题标签包括 Expression profiling by array、GPL17692 和 9606。

【数据内容】

数据集包含 miRNA 和 mRNA 表达数据，样本来源为 CD133+CD15+ 脊索瘤细胞与 CD133-CD15- 脊索瘤细胞。数据以芯片表达谱形式呈现，物种为人类（9606），芯片平台为 GPL17692。数据集以 SuperSeries 形式发布，源站描述说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成。当前可获取的文件数量为 1，文件样例为 GSE109950_series_matrix.txt.gz，即系列矩阵文件，通常以压缩形式提供表达矩阵及样本相关信息。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），由 Emre Can、Tüysüz 提交，发布时间为 2019 年 1 月 31 日。数据采集所涉及的具体实验流程、样本处理细节、芯片杂交与扫描参数等，源站未提供。数据以 SuperSeries 形式组织，其下包含的 SubSeries 具体构成，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于脊索瘤中不同表面标志物表型细胞（CD133+CD15+ 与 CD133-CD15-）之间 miRNA 和 mRNA 表达差异的比较分析，可用于探索脊索瘤干细胞相关表型的转录特征。由于同时包含 miRNA 与 mRNA 表达谱，也适合开展两类分子层面的联合观察。具体分析目标需结合研究者自身问题确定，源站未提供针对特定应用的说明。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE109950_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式。读取时应按文件格式解压并解析系列矩阵内容。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。源站未提供更详细的分析步骤或推荐工具。

【质量与限制】

数据集文件数量为 1，样本规模、重复设置、数据质控指标等信息源站未提供。由于以 SuperSeries 形式发布且由 SubSeries 组成，使用时需注意其组成结构，具体 SubSeries 内容源站未提供。数据仅覆盖 GPL17692 平台与人类物种，跨平台或跨物种外推需谨慎。其他质量相关细节源站未提供。

【引用与许可】

数据来源为 NCBI GEO，提交者为 Emre Can、Tüysüz，发布时间为 2019 年 1 月 31 日。数据集的许可条款与推荐引用格式，源站未提供。使用时应遵循 NCBI GEO 的相关数据使用政策，具体以源站说明为准。