复发与非复发脊索瘤的全基因组DNA甲基化谱分析
该数据集是一个包含26例脊索瘤样本、正常髓核样本及UCH-1细胞系的全基因组DNA甲基化谱数据,数据模态为基因甲基化芯片数据,主要用于研究脊索瘤的肿瘤发生机制、识别复发相关的表观遗传标志物,以及探索DNA甲基化在脊索瘤诊断和治疗中的潜在应用价值。

基本信息
资源简介
复发与非复发脊索瘤的全基因组DNA甲基化谱分析
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome-wide DNA methylation profiling of recurrent and non-recurrent chordomas》。配套论文《Genome-wide DNA methylation profiling of recurrent and non-recurrent chordomas》发表于 Epigenetics(2015),DOI:10.1080/15592294.2015.1006497。源站首次发布:2015-10-20。
【数据内容】
源站原始描述:Chordomas are an aggressive rare type of malignant bone tumors arising from the remnant of the notochord. Chordomas occur mainly in vertebral bones and account for 1–4% of malignant bone tumors. Management and treatment of chordomas are difficult as they are resistant to conventional chemotherapy; therefore, they are mainly treated with surgery and radiation therapy. In this study, we performed DNA methylation profiling of 26 chordomas and normal nucleus pulposus samples plus UCH-1 chordoma cell…
【数据结构与技术规格】
文件数 12 个,合计 5.55 MB。kepi_a_1006497_sm9658.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,13.09 KB。kepi_a_1006497_sm4479.pdf:application/pdf,311.76 KB。kepi_a_1006497_sm4463.pdf:application/pdf,127.64 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.1294980.v4。
【主题与分类】
源站学科分类:Plant Biology、Cancer、Developmental Biology、Biological Sciences、Molecular Biology、Genetics。主题标签:probe、BeadChip methylation data、differentially、bisulfite restriction analysis、Gene expression、Illumina Infinium HumanMethylation 450 BeadChips、DNA、nucleus pulposus samples、chordoma cell lines、methylated chordoma cell lines。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Plant Biology、Cancer、Developmental Biology、Biological Sciences、Molecular Biology、Genetics。
【获取与许可】
源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Genome_wide_DNA_methylation_profiling_of_recurrent_and_non_recurrent_chordomas_/1294980
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Genome-wide DNA methylation profiling of recurrent and non-recurrent chordomas. Taylor & Francis. Alholle, A; T Brini, A; Bauer, J; Gharanei, S; Niada, S; Slater, A; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个针对脊索瘤(一种起源于脊索残余的罕见恶性骨肿瘤)的DNA甲基化研究数据集。数据集包含26例脊索瘤样本、正常髓核样本以及UCH-1脊索瘤细胞系的DNA甲基化数据,使用Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片平台进行全基因组甲基化分析。研究通过比较分析,识别了8819个在脊索瘤与正常组织间差异甲基化的位点,其中2951个位点呈高甲基化,并进一步筛选出104个癌症特异性高甲基化探针。此外,数据集还包含复发与非复发脊索瘤之间的差异甲基化分析结果。该数据集主要用于研究脊索瘤的肿瘤发生机制、探索表观遗传生物标志物,以及分析DNA甲基化与肿瘤复发之间的关联,为脊索瘤的临床诊断和治疗提供表观遗传学依据。
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