复发与非复发脊索瘤的全基因组DNA甲基化谱分析

该数据集是一个包含26例脊索瘤样本、正常髓核样本及UCH-1细胞系的全基因组DNA甲基化谱数据,数据模态为基因甲基化芯片数据,主要用于研究脊索瘤的肿瘤发生机制、识别复发相关的表观遗传标志物,以及探索DNA甲基化在脊索瘤诊断和治疗中的潜在应用价值。

A T Brini; D Gentle; E R Maher; F Latif; V P Sumathi; S Niada; A Slater; A Alholle; S Gharanei; L Jeys; R Grimer; J BauerA T Brini; D Gentle; E R Maher; F Latif; V P Sumathi; S Niada; A Slater; A Alholle; S Gharanei; L Jeys; R Grimer; J Bauer
Taylor & Francis Group
2016-01-19 更新
浏览 17
probeBeadChip methylation datadifferentiallybisulfite restriction analysisGene expressionDNAnucleus pulposus sampleschordoma cell linesmethylated chordoma cell linesIngenuity Pathway Analysischordoma cell lineHumanMethylation 450 BeadChip data
Genome-wide DNA methylation profiling of recurrent and non-recurrent chordomas

基本信息

大小
0.005545929 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2016-01-19
版本
v4

资源简介

复发与非复发脊索瘤的全基因组DNA甲基化谱分析

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Genome-wide DNA methylation profiling of recurrent and non-recurrent chordomas》。配套论文《Genome-wide DNA methylation profiling of recurrent and non-recurrent chordomas》发表于 Epigenetics(2015),DOI:10.1080/15592294.2015.1006497。源站首次发布:2015-10-20。

【数据内容】

源站原始描述:Chordomas are an aggressive rare type of malignant bone tumors arising from the remnant of the notochord. Chordomas occur mainly in vertebral bones and account for 1–4% of malignant bone tumors. Management and treatment of chordomas are difficult as they are resistant to conventional chemotherapy; therefore, they are mainly treated with surgery and radiation therapy. In this study, we performed DNA methylation profiling of 26 chordomas and normal nucleus pulposus samples plus UCH-1 chordoma cell…

【数据结构与技术规格】

文件数 12 个,合计 5.55 MB。kepi_a_1006497_sm9658.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,13.09 KB。kepi_a_1006497_sm4479.pdf:application/pdf,311.76 KB。kepi_a_1006497_sm4463.pdf:application/pdf,127.64 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.1294980.v4。

【主题与分类】

源站学科分类:Plant Biology、Cancer、Developmental Biology、Biological Sciences、Molecular Biology、Genetics。主题标签:probe、BeadChip methylation data、differentially、bisulfite restriction analysis、Gene expression、Illumina Infinium HumanMethylation 450 BeadChips、DNA、nucleus pulposus samples、chordoma cell lines、methylated chordoma cell lines。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Plant Biology、Cancer、Developmental Biology、Biological Sciences、Molecular Biology、Genetics。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Genome_wide_DNA_methylation_profiling_of_recurrent_and_non_recurrent_chordomas_/1294980

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Genome-wide DNA methylation profiling of recurrent and non-recurrent chordomas. Taylor & Francis. Alholle, A; T Brini, A; Bauer, J; Gharanei, S; Niada, S; Slater, A; et al

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Genome_wide_DNA_methylation_profiling_of_recurrent_and_non_recurrent_chordomas_/1294980/3

按页面 Download 按钮获取。

数据说明

该数据集是一个针对脊索瘤(一种起源于脊索残余的罕见恶性骨肿瘤)的DNA甲基化研究数据集。数据集包含26例脊索瘤样本、正常髓核样本以及UCH-1脊索瘤细胞系的DNA甲基化数据,使用Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片平台进行全基因组甲基化分析。研究通过比较分析,识别了8819个在脊索瘤与正常组织间差异甲基化的位点,其中2951个位点呈高甲基化,并进一步筛选出104个癌症特异性高甲基化探针。此外,数据集还包含复发与非复发脊索瘤之间的差异甲基化分析结果。该数据集主要用于研究脊索瘤的肿瘤发生机制、探索表观遗传生物标志物,以及分析DNA甲基化与肿瘤复发之间的关联,为脊索瘤的临床诊断和治疗提供表观遗传学依据。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案