胆管结石与胆管癌患者胆汁微生物组差异数据集
该数据集包含胆管结石和胆管癌患者的胆汁样本，通过16S rRNA基因测序获得微生物组数据，属于基因测序模态，主要用于比较两种疾病状态下胆汁微生物群落的差异，为胆道疾病的微生物标志物发现和机制研究提供数据支持。
基本信息
资源简介
胆管结石与胆管癌患者胆汁微生物组差异数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Differences between microbial communities in bile of choledocholithiasis and cholangiocarcinoma patients》。源站首次发布：2020-09-17。
【数据内容】
源站原始描述：We compared the microbiome in bile fluid of choledocholithiasis patients and cholangiocarcinoma patients. Bile samples were collected from choledocholithiasis and cholangiocarcinoma patients. Microbial profiling was performed individually by the sequencing of V3-V4 regions of the 16S rRNA gene. Choledocholithiasis (E3-E28) and cholangiocarinoma (P4-P27) cases
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 752.10 MB。数据集 DOI：10.17632/y4fm2gbdzf.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/y4fm2gbdzf
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/y4fm2gbdzf
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集通过比较胆管结石（choledocholithiasis）患者与胆管癌（cholangiocarcinoma）患者的胆汁微生物组，旨在揭示两种疾病状态下微生物群落的差异。数据来源于临床收集的胆汁样本，通过16S rRNA基因V3-V4区域测序进行微生物谱分析，包含胆管结石（E3-E28）和胆管癌（P4-P27）病例的测序结果。该数据集主要用于微生物组与疾病关联研究，为胆道疾病的诊断、预后或治疗提供潜在的微生物标志物。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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