ViFoSe合成视频数据集2026

该数据集为合成视频集合,专用于测试和验证前景分割算法,如博洛尼亚大学开发的ViFoSe视频前景分割工具。数据基于高清2D共聚焦显微图像构建,采用HeLa Kyoto宫颈癌细胞与MRC-5人成纤维细胞的共培养体系,其中微管蛋白、mCherry标记的组蛋白H2B及CellTracker分别以不同颜色标记

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2026-03-03 更新
浏览 7
医学影像图像分割Computer VisionImage ProcessingVideo AnalysisImage AlignmentMorphological Operators
ViFoSe_SyntheticVideo_Dataset_2026

基本信息

模态
医学影像
大小
0.01057247 GB
任务类型
图像分割
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-03-03
版本
v1

资源简介

ViFoSe合成视频数据集2026

ViFoSe_SyntheticVideo_Dataset_2026

该数据集为合成视频集合,专用于测试和验证前景分割算法,如博洛尼亚大学开发的ViFoSe视频前景分割工具。数据基于高清2D共聚焦显微图像构建,采用HeLa Kyoto宫颈癌细胞与MRC-5人成纤维细胞的共培养体系,其中微管蛋白、mCherry标记的组蛋白H2B及CellTracker分别以不同颜色标记有丝分裂细胞、成纤维细胞胞质和细胞外囊泡,固定培养物经DAPI复染。数据集共含18个文件,可用于评估视频前景分割与图像对齐等计算机视觉任务(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026-03-03。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):COLLECTION ITEM:文章数据 PROJECT TITLE:2026_PiccininiEtAl_ViFoSe 集合中文件的描述:该数据集包含专门设计用于测试和验证前景分割算法的合成视频,例如博洛尼亚大学开发的ViFoSe(视频前景分割)工具。一张高清2D共聚焦显微图像代表了一种标准场景,其中对象(此处为细胞)的边界对比良好且清晰可见。具体而言,使用了HeLa Kyoto宫颈癌细胞(表达EGFP-alpha-tubulin/H2B-mCherry)与用CellTracker Deep Red标记的MRC-5人成纤维细胞的共培养物。微管蛋白(绿色)和mCherry标记的组蛋白H2B(黄色)清晰地突出有丝分裂细胞,而CellTracker(红色)则显示成纤维细胞胞质和细胞外囊泡。固定培养物用DAPI复染

【数据结构与技术规格】

文件数 18 个,合计 10.57 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.31454956.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Image processing、Computer vision、Biomedical imaging、Automated software engineering、Biomedical engineering not elsewhere classified、Medical microbiology not elsewhere classified。主题标签:Computer Vision、Image Processing、Video Analysis、Image Alignment、Morphological Operators。本站分类:肿瘤/宫颈癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Image processing、Computer vision、Biomedical imaging、Automated software engineering、Biomedical engineering not elsewhere classified、Medical microbiology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/ViFoSe_SyntheticVideo_Dataset_2026/31454956

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Piccinini, Filippo (2026). ViFoSe_SyntheticVideo_Dataset_2026. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.31454956.v1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 10.6 MB。

数据说明

采集项目:文章数据 项目标题:2026_PiccininiEtAl_ViFoSe 采集文件描述:本数据集包含专门设计用于测试和验证前景分割算法的合成视频,例如博洛尼亚大学开发的ViFoSe(视频前景分割)工具。一张高清2D共聚焦显微镜图像展示了一个标准场景,其中物体(此处为细胞)的边界对比鲜明且清晰可见。具体而言,使用了表达EGFP-α-微管蛋白/H2B-mCherry的HeLa Kyoto宫颈癌细胞与用CellTracker Deep Red标记的MRC-5人成纤维细胞的共培养物。微管蛋白(绿色)和mCherry标记的组蛋白H2B(黄色)清晰地突出了有丝分裂细胞,而CellTracker(红色)则显示了成纤维细胞质和细胞外囊泡。固定培养物用DAPI(蓝色)复染,与H2B产生明亮的共定位信号。使用模拟动态相机的自定义MATLAB算法生成了每段10帧的合成视频。

选取原始图像中心一个500×500像素区域保持固定,作为整个视频序列的参考首帧。随后从源图像中随机提取500×500像素的后续帧,同时遵循与参考帧之间11种不同的重叠百分比,范围从5%到20%,以1%递增。该实验设计共产生11种不同的重叠配置,从而能够随着连续帧之间重叠程度的变化,对算法性能进行细粒度评估。对于每种重叠百分比,合成视频以MP4格式提供,并附有MAT格式的元数据,其中包括每帧在源图像中的精确坐标以及有效重叠的验证。此外,还包含PNG和PDF格式的可视化结果,显示所有帧在原始图像上的位置。原始图像、M

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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