PXD008723:早期宫颈癌蛋白质组学改变

宫颈癌具有明确的癌前阶段宫颈上皮内瘤变(CIN)。人群筛查发现高级别CIN并治疗,已显著降低宫颈癌发病率和死亡率。基于细胞学的宫颈涂片检查应用最广,但不理想,对CIN2+的敏感性仅约55%

pride
2018-05-03 更新
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蛋白质分类Cervical cancerProteomicsPrmLcmBiomarker
PXD008723: Proteomic alterations in early stage cervical cancer

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2018-05-03

资源简介

PXD008723:早期宫颈癌蛋白质组学改变

宫颈癌具有明确的癌前阶段宫颈上皮内瘤变(CIN)。人群筛查发现高级别CIN并治疗,已显著降低宫颈癌发病率和死亡率。基于细胞学的宫颈涂片检查应用最广,但不理想,对CIN2+的敏感性仅约55%。因此需要更敏感、特异的宫颈癌及癌前阶段生物标志物。相关标签涉及蛋白质组学、PRM、LCM、生物标志物、人及Orbitrap Fusion(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):宫颈癌以存在明确的癌前阶段——宫颈上皮内瘤变(CIN)为特征。通过基于人群的筛查项目识别高级别CIN病变并随后进行治疗,已使宫颈癌的发病率和死亡率显著降低。基于细胞学的宫颈涂片检测是最广泛使用的宫颈癌筛查方法,但并不理想,因为其检测CIN2及以上(CIN2+)的敏感性仅为约55%。因此,需要更敏感、更特异的宫颈癌及其癌前阶段生物标志物。

【主题与分类】

主题标签:Cervical cancer、Proteomics、Prm、Lcm、Biomarker。本站分类:肿瘤/宫颈癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD008723

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

宫颈癌以存在明确的癌前阶段——宫颈上皮内瘤变(CIN)为特征。通过基于人群的筛查项目识别高级别CIN病变并随后进行治疗,已使宫颈癌的发病率和死亡率显著降低。基于细胞学的宫颈涂片检测是最广泛使用的宫颈癌筛查方法,但并不理想,因为其检测CIN2及以上(CIN2+)的敏感性仅为约55%。因此,需要更敏感、更特异的宫颈癌及其癌前阶段生物标志物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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