基本信息

模态

时间序列

任务类型

预测

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1518336：AP1S1 通过 HOXC4/TRIM23/COX5B 轴驱动宫颈癌进展

PRJNA1518336 是一个围绕宫颈癌进展机制研究的生物项目数据集，其英文全称为“AP1S1 drives cervical cancer progression via HOXC4/TRIM23/COX5B axis”。该数据集由 NCBI 的 BioProject 数据库收录，源站标题为“ID 1518336 - BioProject - NCBI”，本站将其归类于肿瘤 / 宫颈癌方向。数据以原始测序读段（Raw sequence reads）的形式提供，主题标签即为 Raw sequence reads。从整体定位来看，该数据集服务于探索宫颈癌进展相关分子机制、基因表达调控及潜在标志物的研究需求，适合开展转录组分析、通路验证和预后预测等工作。其核心科学线索指向 AP1S1 通过 HOXC4/TRIM23/COX5B 轴驱动宫颈癌进展这一假设，为研究者提供了一个可追溯、可链接多种数据类型的数据入口。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种生物数据集合记录形式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的各类生物数据。该计划可以来源于一个组织，也可以来源于一个联合体。BioProject 记录的核心价值在于，它为用户提供了一个统一的位置，用以查找该项目所产生的不同数据类型之间的链接。PRJNA1518336 正是这样一个记录，其标题明确指向宫颈癌进展的分子机制研究，具体涉及 AP1S1 基因以及 HOXC4/TRIM23/COX5B 这一信号轴。本站将其归入肿瘤 / 宫颈癌分类，说明该数据集在疾病领域上聚焦于宫颈癌这一恶性肿瘤，在数据用途上则与肿瘤发生发展机制的研究密切相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始测序读段。这意味着数据以测序仪直接产出的读段形式存在，属于未经高级加工或注释的原始序列数据。此类数据通常可用于后续的比对、组装、表达定量和变异检测等分析流程。源站描述指出，BioProject 记录本身并不限定单一数据类型，而是提供指向该项目所生成的各种数据类型的链接。因此，PRJNA1518336 所涵盖的具体数据文件、样本数量、测序平台、读长、覆盖度等信息，源站未提供。数据内容的核心主题围绕宫颈癌进展，并与 AP1S1、HOXC4、TRIM23、COX5B 等分子要素相关。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）。数据集英文名中的“PRJNA1518336”是其在 NCBI BioProject 数据库中的唯一标识，源站标题为“ID 1518336 - BioProject - NCBI”。根据源站描述，BioProject 记录可来源于单一组织或联合体，但该具体项目的提交机构、研究团队、样本采集地点、采集时间、伦理审批信息等，源站未提供。数据以 Raw sequence reads 形式提供，说明其原始测序读段已归档于 NCBI 相关数据库，但具体的测序中心、建库方法、测序试剂与仪器型号等信息，源站未提供。

【适用场景】

基于该数据集以原始测序读段形式提供，且主题聚焦于宫颈癌进展，其适用场景包括：探索宫颈癌进展相关的分子机制，例如围绕 AP1S1 及其下游 HOXC4/TRIM23/COX5B 轴的功能与调控关系；开展转录组分析，从原始读段出发进行表达谱重建与差异表达分析；进行通路验证，针对该轴所涉及的信号通路进行独立数据验证；以及潜在标志物的发现与预后预测研究。此外，由于 BioProject 记录可链接多种数据类型，该数据集也可能作为入口，帮助研究者定位同一项目下的其他相关数据资源。但具体可支持的分析类型仍取决于原始读段的质量、样本设计与元数据完整度，这些信息源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 数据库，以标识 PRJNA1518336 或标题“ID 1518336 - BioProject - NCBI”进行检索，进入该项目的记录页面。BioProject 记录的设计目的即是让用户在一个统一位置找到该项目所生成的不同数据类型的链接。因此，使用者可从该记录出发，跳转至与之关联的原始测序读段数据。对于 Raw sequence reads，常规使用方式包括下载读段文件后，进行质量控制、比对至参考基因组、转录本定量、差异表达分析、通路富集分析等。但具体的下载路径、文件格式、参考基因组版本、分析工具参数等，源站未提供，需使用者依据 NCBI 页面实际链接和自身研究设计进行操作。

【质量与限制】

该数据集以原始测序读段形式提供，原始读段通常需要经过质量控制与预处理才能用于下游分析，其数据质量取决于测序深度、读长、碱基质量、重复率、污染水平等因素，而这些具体指标源站未提供。此外，BioProject 记录本身是一个项目层面的集合入口，并不等同于经过统一整理和注释的分析就绪数据集。该项目的样本量、生物学重复、实验设计、批次效应、临床信息关联等关键元数据，源站未提供。因此，使用者在解释结果时需注意数据来源的原始性与项目描述的有限性，不宜直接将该数据集视为已验证的结论性资源。该数据集标题所指向的 AP1S1/HOXC4/TRIM23/COX5B 轴属于该项目的科学假设或研究主题，而非本站可独立验证的结论。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1518336 - BioProject - NCBI”，英文名为“PRJNA1518336: AP1S1 drives cervical cancer progression via HOXC4/TRIM23/COX5B axis”。关于该数据集的正式引用格式、文献出处、提交者信息、许可协议、使用条款及数据共享政策等，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应直接访问 NCBI BioProject 记录页面，以获取最新的引用要求与许可说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1518336

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1518336

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

宫颈癌是女性癌症相关死亡的主要原因之一，但其潜在的分子机制仍知之甚少。在本研究中，我们采用bulk RNA测序（RNA-seq）和蛋白质组学分析来探究AP1S1在宫颈癌进展中的作用。我们证明AP1S1在肿瘤组织中显著上调，并与不良预后相关。在机制上，AP1S1与HOXC4相互作用，抑制TRIM23介导的COX5B泛素化，从而增强氧化磷酸化并促进肿瘤细胞增殖和迁移。该数据集包含由SiHa宫颈癌细胞生成的原始测序reads，以支持本研究的发现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别