宫颈病变筛查的DNA甲基化检测数据集
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦肿瘤/宫颈癌方向,用于比较DNA甲基化检测、高危HPV亚型检测与细胞学检查在宫颈病变筛查中的表现

基本信息
资源简介
宫颈病变筛查的DNA甲基化检测数据集
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦肿瘤/宫颈癌方向,用于比较DNA甲基化检测、高危HPV亚型检测与细胞学检查在宫颈病变筛查中的表现。研究纳入300例具有明确组织学结果的患者,利用临床采集的宫颈细胞学标本进行DNA甲基化、高危HPV亚型及薄层液基细胞学检测(TCT),并基于已知组织学结果计算灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值,同时分析DNA甲基化与高危HPV及TCT的差异。数据可用于宫颈病变筛查方法的效能评估与分类模型研究(来源 clinicaltrials.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):条件:DNA甲基化、宫颈癌、高级别鳞状上皮内病变、低级别鳞状上皮内病变。本研究的主要目的是在一项前瞻性队列研究中,将DNA甲基化检测、高危HPV亚型检测和细胞学检查与宫颈病变的明确组织学结果进行比较。本研究将纳入300例具有明确组织学结果的非选择性患者。临床环境中采集的所有宫颈细胞学标本将用于DNA甲基化、高危HPV亚型和薄层液基细胞学检测(TCT)。基于已知组织学结果计算灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值。还将分析DNA甲基化与高危人乳头瘤病毒(HPV)及TCT的差异。该检
【主题与分类】
主题标签:DNA Methylation、Uterine Cervical Cancer。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03960879
下载信息
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数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03960879
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:DNA甲基化、宫颈癌、高级别鳞状上皮内病变、低级别鳞状上皮内病变。本研究的主要目的是在一项前瞻性队列研究中,将DNA甲基化检测、高危HPV亚型检测及细胞学检查与宫颈病变的明确组织学结果进行比较。本研究将纳入300例具有明确组织学结果的非选择性患者。临床环境中采集的所有宫颈细胞学标本将用于DNA甲基化检测、高危HPV亚型检测及薄层液基细胞学检查(TCT)。根据已知的组织学结果计算敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值。还将分析DNA甲基化与高危人乳头瘤病毒(HPV)及TCT之间的差异。DNA甲基化检测将采用甲基化特异性聚合酶链反应(PCR)进行。TCT和HPV检测将采用罗氏试剂盒进行。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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