原发性中枢神经系统淋巴瘤的基因组与转录组图谱数据集
该数据集包含原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）患者的多模态生物医学数据，主要涵盖基因组学数据（如体细胞拷贝数变异、单核苷酸变异、结构变异和RNA-seq读段计数）以及原始病理图像（如免疫组化染色图像），旨在通过整合全基因组和转录组测序信息，系统解析PCNSL的分子特征，并支持中枢神经系统淋巴瘤的分子机制研究、生物标志物发现及与系统性淋巴瘤的对比分析。
基本信息
资源简介
原发性中枢神经系统淋巴瘤的基因组与转录组图谱数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The genomic and transcriptional landscape of primary central nervous system lymphoma》。源站首次发布：2021-07-15。
【数据内容】
源站原始描述：Primary lymphomas of the central nervous system (PCNSL) are mainly diffuse large B-cell lymphomas (DLBCLs) confined to the central nervous system (CNS). Despite extensive research, the molecular alterations leading to PCNSL have not been fully elucidated. In order to provide a comprehensive description of the genomic and transcriptional landscape of PCNSL, we here performed whole-genome and transcriptome sequencing and integrative analysis of 51 lymphomas presenting in the CNS, including 42 EBV-…
主表 Radke_et_al_supplementary_somatic_SNVs_rescued_by_TiNDA.tsv 含 21 列、样本前 1147 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 25 个，合计 805.77 MB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.6054242。
【主题与分类】
主题标签：PCNSL、somatic mutations、snv、indel、structural variations、cna、cancer genomics。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/6054242
使用许可：cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-07-17，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/record/5106350
（注册/登录后按页面指引下载）
数据说明
该数据集旨在全面描述原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）的基因组和转录组特征。数据集包含51例中枢神经系统淋巴瘤样本（包括42例EBV阴性PCNSL、6例继发性CNS淋巴瘤和3例EBV阳性CNSL）及其对照的全基因组和转录组测序数据，并整合了来自独立验证队列的31例FFPE样本和36例系统性DLBCL病例的数据。数据内容涵盖体细胞拷贝数变异、插入缺失、单核苷酸变异、结构变异以及RNA-seq读段计数等多种基因组学数据，同时提供研究中使用的原始未编辑图像文件（如免疫组化染色图像）。该数据集可用于探索PCNSL的分子机制、识别驱动基因变异、比较CNS淋巴瘤与系统性淋巴瘤的差异，并为该疾病的诊断和治疗研究提供数据基础。
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