全基因组测序提升原发灶不明癌症的组织起源诊断与治疗选择
该数据集提供了用于分析原发灶不明癌症（CUP）全基因组测序数据的R语言代码，主要数据模态为分析代码与相关的基因组特征信息，旨在通过计算生物标志物来提升癌症组织起源的诊断准确性，并探索潜在的治疗选择，服务于癌症基因组学与精准医疗的研究方向。
基本信息
资源简介
全基因组测序提升原发灶不明癌症的组织起源诊断与治疗选择
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Whole genome sequencing improves tissue of origin diagnosis and treatment options for cancer of unknown primary》。配套论文《Whole genome sequencing improves tissue-of-origin diagnosis and treatment options for cancer of unknown primary》发表于 Nature Communications（2025），DOI：10.1038/s41467-025-59661-x。源站首次发布：2025-05-21。
【数据内容】
源站原始描述：1. figs.Rmd contains code that generated all figures except for the panel signature figure (Fig. 2) 2. panel.Rmd contains code for the panel sig figure (Fig. 2)
文件 figs.Rmd 为文本内容，开头为：- title: "Untitled" output: html_document date: "2024-07-02" - ```{r setup, include=FALSE} knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ``` ```{r} library(readr) li…
文件 panel.Rmd 为文本内容，开头为：- title: "panel" output: html_document date: "2024-03-11" editor_options: chunk_output_type: console - ```{r setup, include=FALSE} knitr::opts_chunk$se…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 58.89 KB。figs.Rmd：text/plain，33.22 KB。panel.Rmd：text/plain，25.68 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.26518669.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cancer Diagnosis、Cancer Genetics、Medical Genetics (excl. Cancer Genetics)。主题标签：Cancer of unknown primary origin (CUP)、Whole Genome Sequencing Data。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cancer Diagnosis、Cancer Genetics、Medical Genetics (excl. Cancer Genetics)。
【获取与许可】
源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Whole_genome_sequencing_improves_tissue_of_origin_diagnosis_and_treatment_options_for_cancer_of_unknown_primary/26518669
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Rebello, Richard; Posner, Atara; Dong, Ruining; PRALL, OWEN; Sivakumaran, Tharani; Mitchell, Camilla; et al. (2025). Whole genome sequencing improves tissue of origin diagnosis and treatment options for cancer of unknown primary. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个关于原发灶不明癌症（CUP）的研究数据集，主要包含用于生成研究论文中所有图表（除图2外）的R代码文件（figs.Rmd），以及专门用于生成图2（panel signature figure）的R代码文件（panel.Rmd）。这些代码基于全基因组测序数据，旨在通过分析肿瘤基因组特征来改进CUP的组织起源诊断，从而为患者提供更精准的治疗选择。数据来源于相关癌症基因组学研究，主要应用于癌症基因组学、生物信息学分析和临床诊断策略开发领域。
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