CUPiD：一种基于cfDNA甲基化的原发灶不明癌组织来源分类器 - 图表生成数据与代码
该数据集提供了基于循环游离DNA（cfDNA）甲基化特征的原发灶不明癌组织来源分类器研究所需的图表生成代码与输入数据，包含临床数据、分类器输出及RMarkdown脚本等多模态资源，主要用于支持原发灶不明癌的起源诊断、生物标志物开发和甲基化分析方法验证，可促进癌症精准医疗与转化研究。
基本信息
资源简介
该数据集存储了论文《A cfDNA methylation-based tissue-of-origin classifier for Cancers of Unknown Primary》（Conway、Pearce、Clipson等人合著，发表于《Nature Communications》）中用于生成所有图表的代码与数据。数据集主要包括两部分：figure_inputs（包含生成图表所需的输入数据，部分来自分类器的生成与应用过程，部分为额外的临床数据）和figure_generation（基于figure_inputs中的输入文件、用于生成论文图表的RMarkdown报告）。该数据集还提供了输出文件夹（output）和源数据文件夹（source_data），其中包含补充数据表、图表副本以及ROC曲线等大型源数据。该数据集主要用于支持原发灶不明癌（CUP）的研究，特别是基于循环游离DNA（cfDNA）甲基化特征的组织来源分类方法开发与验证，可应用于癌症起源诊断、生物标志物发现和临床转化研究。
下载信息
注册下载
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暂未开放公开下载
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免登录有偿下载
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10684337
（注册/登录后按页面指引下载）
数据说明
该数据集存储了论文《A cfDNA methylation-based tissue-of-origin classifier for Cancers of Unknown Primary》（Conway、Pearce、Clipson等人合著，发表于《Nature Communications》）中用于生成所有图表的代码与数据。数据集主要包括两部分：figure_inputs（包含生成图表所需的输入数据，部分来自分类器的生成与应用过程，部分为额外的临床数据）和figure_generation（基于figure_inputs中的输入文件、用于生成论文图表的RMarkdown报告）。该数据集还提供了输出文件夹（output）和源数据文件夹（source_data），其中包含补充数据表、图表副本以及ROC曲线等大型源数据。该数据集主要用于支持原发灶不明癌（CUP）的研究，特别是基于循环游离DNA（cfDNA）甲基化特征的组织来源分类方法开发与验证，可应用于癌症起源诊断、生物标志物发现和临床转化研究。
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