MET500转移癌队列
MET500包含多癌种转移肿瘤的基因组和转录组数据,可用于转移癌组织起源识别研究。由University of Michigan提供,包含多种数据模态,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的原发灶不明癌研究。

基本信息
资源简介
MET500转移癌队列
【一句话概览】
MET500 数据集可从 dbGap 下载,其表达数据也可在 UCSC Xena 获取。该数据集相关标签包括 MET500、expression data、dbGap 和 UCSC Xena(来源 met500.med.umich.edu)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《MET500》。
【数据内容】
源站原始描述:MET500 datasets can be downloaded from dbGap . You also can find expression data from the MET500 study at UCSC Xena
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):MET500数据集可从dbGap下载。你也可以在UCSC Xena找到MET500研究的表达数据。
【主题与分类】
主题标签:MET500、expression data、dbGap、UCSC Xena。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://met500.med.umich.edu/downloadMet500DataSets
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://met500.med.umich.edu/downloadMet500DataSets
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
MET500包含多癌种转移肿瘤的基因组和转录组数据,可用于转移癌组织起源识别研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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