MET500转移癌队列

MET500包含多癌种转移肿瘤的基因组和转录组数据,可用于转移癌组织起源识别研究。由University of Michigan提供,包含多种数据模态,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的原发灶不明癌研究。

University of MichiganUniversity of Michigan
MET500
浏览 40
多模态分类MET500expression datadbGapUCSC Xena
MET500

基本信息

模态
多模态
数据量
500
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-09-28

资源简介

MET500转移癌队列

【一句话概览】

MET500 数据集可从 dbGap 下载,其表达数据也可在 UCSC Xena 获取。该数据集相关标签包括 MET500、expression data、dbGap 和 UCSC Xena(来源 met500.med.umich.edu)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《MET500》。

【数据内容】

源站原始描述:MET500 datasets can be downloaded from dbGap . You also can find expression data from the MET500 study at UCSC Xena

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):MET500数据集可从dbGap下载。你也可以在UCSC Xena找到MET500研究的表达数据。

【主题与分类】

主题标签:MET500、expression data、dbGap、UCSC Xena。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://met500.med.umich.edu/downloadMet500DataSets

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使用方式

数据集获取

源站:https://met500.med.umich.edu/downloadMet500DataSets

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MET500包含多癌种转移肿瘤的基因组和转录组数据,可用于转移癌组织起源识别研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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