PEP008 处理人细胞系 MCF7、COLO-205 和 SK-MEL-5 的转录谱分析

从名称可以看出,该数据集涉及三种人类细胞系——MCF7、COLO-205和SK-MEL-5——在接受PEP008处理后的转录谱分析

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基因组分类肿瘤癌症总论转录谱细胞系PEP008MCF7COLO-205SK-MEL-5
Transcription profiling of human cell lines MCF7, COLO-205 and SK-MEL-5 following treatment with PEP008

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-14

资源简介

PEP008 处理人细胞系 MCF7、COLO-205 和 SK-MEL-5 的转录谱分析

该数据集英文名称为“Transcription profiling of human cell lines MCF7, COLO-205 and SK-MEL-5 following treatment with PEP008”,在来源站被归入肿瘤 / 癌症(总论)分类,属于肿瘤领域的公开数据集,主题涵盖肿瘤。数据集来源于ebi.ac.uk,原始描述由Glen Boyle于2008年提供,并附有ArrayExpress研究编号E-GEOD-8742。从名称可以看出,该数据集涉及三种人类细胞系——MCF7、COLO-205和SK-MEL-5——在接受PEP008处理后的转录谱分析。整体而言,这是一项围绕肿瘤细胞系在特定处理条件下基因表达变化的研究型数据资源,适合关注肿瘤转录组、细胞系实验以及药物或化合物处理响应的研究人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集由Glen Boyle于2008年发布,来源站为ebi.ac.uk,对应ArrayExpress研究编号E-GEOD-8742。其英文标题明确指向三种人类细胞系——MCF7、COLO-205和SK-MEL-5——在接受PEP008处理后的转录谱分析。数据集在来源站被归类为肿瘤 / 癌症(总论),说明其主题属于肿瘤领域的公开数据资源。关于该研究的具体立项背景、科学假设、实验目的以及PEP008的详细性质,源站未提供。

【数据内容】

从数据集名称可知,其内容为转录谱分析,涉及MCF7、COLO-205和SK-MEL-5三种人类细胞系,并围绕PEP008处理后的表达变化展开。该数据集属于肿瘤 / 癌症(总论)分类,主题涵盖肿瘤。关于转录谱的具体检测平台、样本数量、基因覆盖范围、表达值类型、分组设计以及数据文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为ebi.ac.uk,原始描述标注为Glen Boyle (2008),并给出了ArrayExpress研究编号E-GEOD-8742。数据集英文名称完整记录了所涉及的细胞系和处理条件。关于样本采集的具体流程、细胞培养条件、PEP008的处理浓度与时间、实验重复次数以及数据生成的技术路线,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤领域的转录组研究,尤其是关注MCF7、COLO-205和SK-MEL-5三种人类细胞系在PEP008处理条件下基因表达变化的研究场景。由于来源站将其归入肿瘤 / 癌症(总论),它可用于肿瘤相关的基础研究、细胞系表达谱比较以及处理响应分析等方向。关于该数据集是否适用于临床转化、药物开发或特定癌种分型等具体应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站ebi.ac.uk获取,对应ArrayExpress研究编号E-GEOD-8742。使用者可依据该编号在来源站检索并下载相关数据。关于数据下载后的具体处理步骤、分析流程、标准化方法、软件工具要求以及是否需要额外元数据,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于ebi.ac.uk,具有明确的研究编号和发布年份,属于公开可获取的肿瘤领域数据资源。其标题清晰说明了涉及的细胞系和处理条件。关于数据质量评估指标、样本量大小、技术偏差、批次效应、数据完整性以及使用时的注意事项,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Glen Boyle (2008). Transcription profiling of human cell lines MCF7, COLO-205 and SK-MEL-5 following treatment with PEP008 [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-8742。关于该数据集的许可条款、使用限制、商业用途规定以及再分发条件,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-8742

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Glen Boyle (2008). Transcription profiling of human cell lines MCF7, COLO-205 and SK-MEL-5 following treatment with PEP008 [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-8742

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