phs001584:eMERGE网络第三阶段:83,000余名参与者的HRC插补芯片数据
从名称可知,它属于 eMERGE Network 第三阶段,包含 83,000 名以上参与者的 HRC 插补芯片数据。其在站内被归入肿瘤 / 癌症(总论)类别

基本信息
资源简介
phs001584:eMERGE网络第三阶段:83,000余名参与者的HRC插补芯片数据
该数据集为 phs001584: eMERGE Network Phase III: HRC Imputed Array Data of 83,000+ Participants,属于肿瘤 / 癌症(总论)分类,来自 ncbi.nlm.nih.gov,是一项 dbGaP 研究,采用案例-对照设计,主题标签为 Case-Control。
【数据集背景】
该数据集英文全称为 phs001584: eMERGE Network Phase III: HRC Imputed Array Data of 83,000+ Participants。从名称可知,它属于 eMERGE Network 第三阶段,包含 83,000 名以上参与者的 HRC 插补芯片数据。其在站内被归入肿瘤 / 癌症(总论)类别。源站描述显示该研究为 dbGaP study,设计类型为 Case-Control。主题标签为 Case-Control。关于 eMERGE Network 第三阶段的具体目标、组织架构、招募地区和时间跨度,源站未提供。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 HRC 插补的芯片数据(HRC Imputed Array Data),覆盖 83,000 名以上参与者。数据以案例-对照(Case-Control)为设计框架。关于具体包含哪些变量、基因型位点数量、插补参考面板版本、样本量精确数值、表型定义、癌症类型细分等,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。dbGaP 通常用于存储和分发大规模遗传研究数据。该数据集的具体采集时间、采集地点、招募方式、伦理审批信息、原始芯片平台等,源站未提供。
【适用场景】
源站未提供该数据集的具体适用场景。就一般领域常识而言,案例-对照设计的遗传数据常用于关联分析、风险位点识别、多基因风险评分构建等研究。但本数据集是否适合这些用途,需依据其实际变量和质控情况判断。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法或访问流程。通常 dbGaP 研究需要通过授权访问或受控访问流程获取个体层级数据。但本数据集的具体申请条件、审批周期、数据下载格式、配套文档等,源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息、质控指标、缺失率、插补准确性等。作为插补数据,其质量可能受原始芯片覆盖度、参考面板匹配度、插补算法等因素影响,但本数据集的实际质量指标,源站未提供。此外,案例-对照设计可能存在选择偏倚、混杂等一般性限制,具体到本数据集的情况,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议、使用条款或数据共享政策。如需引用或使用,建议参考 ncbi.nlm.nih.gov 上该 dbGaP 研究页面的官方说明。但具体引用与许可信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001584
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case-Control).
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