phs000944:Partners HealthCare 的 eMERGE 临床中心

本站将其归入肿瘤 / 癌症(总论)分类,主题标签为 Cross-Sectional。数据可支持横断面层面的临床与遗传关联分析,用于探索疾病与暴露或特征之间的分布关系

dbgap
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基因组Cross-Sectional
phs000944: eMERGE Clinical Center at Partners HealthCare

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000944:Partners HealthCare 的 eMERGE 临床中心

phs000944: eMERGE Clinical Center at Partners HealthCare 是一个收录于 NCBI dbGaP 的研究数据集,源站将其标注为横断面研究(Cross-Sectional)。本站将该数据集归入肿瘤 / 癌症(总论)分类,主题标签为 Cross-Sectional。从整体定位看,该数据集可用于横断面层面的临床与遗传关联分析,帮助研究者探索疾病与暴露或特征之间的分布关系。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 体系下的研究资源,适合需要围绕临床与遗传信息开展横断面观察性分析的用户关注与使用。

【数据集背景】

该数据集英文名称为 phs000944: eMERGE Clinical Center at Partners HealthCare,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述为 dbGaP study (Cross-Sectional)。本站将其归入肿瘤 / 癌症(总论)分类,主题标签为 Cross-Sectional。eMERGE 通常与电子病历与基因组学结合的研究网络相关,Partners HealthCare 则是临床中心名称的一部分。基于现有信息,该数据集属于 dbGaP 收录的横断面研究,其背景与临床中心参与的研究项目相关。关于该研究的具体立项背景、研究目的、牵头机构、资助来源以及伦理审批信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Cross-Sectional,源站描述为 dbGaP study (Cross-Sectional)。本站将其归入肿瘤 / 癌症(总论)分类。数据可支持横断面层面的临床与遗传关联分析,用于探索疾病与暴露或特征之间的分布关系。关于数据集包含的具体变量、样本量、遗传数据类型、临床表型字段、随访信息、数据文件格式与规模等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述为 dbGaP study (Cross-Sectional)。其英文名称中包含 eMERGE Clinical Center at Partners HealthCare,提示该数据与 Partners HealthCare 临床中心相关。关于数据采集的时间范围、采集地点、纳入与排除标准、样本采集流程、知情同意方式以及数据提交与更新记录,源站未提供。

【适用场景】

基于本站分类与主题标签,该数据集可支持横断面层面的临床与遗传关联分析,用于探索疾病与暴露或特征之间的分布关系。其被归入肿瘤 / 癌症(总论)分类,因此可能适用于肿瘤 / 癌症总论方向下、需要结合临床与遗传信息进行横断面观察的研究场景。关于该数据集是否适用于纵向分析、因果推断、特定癌种分析、药物基因组学分析或临床决策支持等具体场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 体系,源站描述为 dbGaP study (Cross-Sectional)。通常 dbGaP 数据的使用需要遵循源站的数据访问流程与授权要求。关于该数据集的具体下载方式、访问权限层级、是否需要提交数据使用申请、是否需要机构审查委员会或伦理委员会审批、是否有受控访问与公开访问之分,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为横断面研究,源站描述为 dbGaP study (Cross-Sectional)。横断面设计通常只能反映某一时点或某一时期的疾病与暴露或特征之间的分布关系,一般不支持直接推断时间先后或因果关系。关于该数据集的具体样本量、缺失值情况、数据完整性、质量控制指标、批次效应、人群代表性、偏倚风险以及验证情况,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集英文名称为 phs000944: eMERGE Clinical Center at Partners HealthCare,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的正式引用格式、文献出处、数据使用协议、许可条款、版权归属、二次分发限制以及商业使用规定,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000944

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Cross-Sectional).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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