PDB: 7E9B，PD-1 与 HLX10 抗体复合物（312K，39°C，100 ns）

资源简介

PDB: 7E9B，PD-1 与 HLX10 抗体复合物（312K，39°C，100 ns）

该数据集为 PDB 结构 7E9B，展示程序性细胞死亡蛋白 1（PD-1）与 HLX10 抗体形成的复合物。其模拟条件为 312K、39°C、100 ns，并在模拟过程中每 50 ns 获取一次 PDB 结构。数据集由作者 Stan, Razvan 发布，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年。本站将其归类于肿瘤 / 癌症（总论）方向，来源站为 doi.org。主题标签涵盖计算机与信息科学、医学、健康与生命科学，以及 fever、cancer、immunotherapy、inflammation、PD-1 等关键词。整体而言，该数据集围绕 PD-1 与 HLX10 抗体的复合物结构展开，提供了在特定温度和时长条件下多个时间点的结构快照，可供相关研究参考。

【数据集背景】

程序性细胞死亡蛋白 1（PD-1）是免疫检查点研究中的重要靶点，与抗体结合后的复合物结构有助于理解免疫治疗相关机制。该数据集聚焦于 PD-1 与 HLX10 抗体形成的复合物，属于肿瘤 / 癌症（总论）分类下的结构数据。其主题标签涉及免疫治疗、炎症、发热以及癌症等方向，反映出该数据可能用于免疫检查点抑制剂相关的研究背景。来源站为 doi.org，作者为 Stan, Razvan，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年。源站描述指出，该数据对应 PDB 结构 7E9B，模拟条件为 312K、39°C、100 ns，并且每 50 ns 获取一次 PDB 结构。

【数据内容】

该数据集的核心内容为 PDB 结构 7E9B，即 PD-1 与 HLX10 抗体形成的复合物。根据源站描述，模拟在 312K、39°C 条件下进行，总时长为 100 ns，并且每 50 ns 获取一次 PDB 结构。这意味着数据集中可能包含多个时间点的结构文件，用于反映复合物在模拟过程中的构象变化。本站分类为肿瘤 / 癌症（总论），主题标签包括 Computer and Information Science、Medicine, Health and Life Sciences、fever、cancer、immunotherapy、inflammation、PD-1。除上述信息外，源站未提供更多关于原子坐标、分辨率、文件格式或具体结构细节的描述。

【采集与来源】

该数据集来源于 doi.org，作者为 Stan, Razvan，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年。源站描述明确给出了 PDB 编号 7E9B，以及模拟条件 312K、39°C、100 ns，并说明每 50 ns 获取一次 PDB 结构。关于具体的采集设备、模拟软件、力场参数、采样方法或数据加工流程，源站未提供。数据集的来源站和机构信息表明其通过 Harvard Dataverse 进行发布与共享，但更详细的采集背景和实验设计信息未在已有描述中体现。

【适用场景】

基于其主题标签和内容，该数据集可能适用于与 PD-1/PD-L1 免疫检查点、抗体结合、免疫治疗、炎症及发热相关的研究场景。由于数据涉及 PD-1 与 HLX10 抗体的复合物结构，并包含不同时间点的 PDB 结构，可能用于分析复合物在模拟过程中的结构变化或构象动态。其分类为肿瘤 / 癌症（总论），因此也可能服务于癌症免疫治疗领域的结构生物学或计算生物学研究。此外，主题标签中的 Computer and Information Science 表明该数据可能被用于计算方法、数据分析或信息科学相关的研究。但具体适用场景需结合用户自身研究目的判断，源站未提供明确的推荐用途。

【使用方法】

该数据集以 PDB 结构形式提供，源站描述指出每 50 ns 获取一次 PDB 结构，因此使用者可能需要按照时间点获取相应的结构文件，并利用分子可视化或结构分析工具进行查看与处理。由于模拟条件为 312K、39°C、100 ns，使用时可结合这些条件理解结构快照的物理背景。关于具体的文件组织方式、命名规则、下载方式、软件兼容性或分析流程，源站未提供。使用者应根据自身需求，结合 PDB 结构的一般使用方式进行处理，但不应将通用方法视为该数据集特有的说明。

【质量与限制】

该数据集提供了 PD-1 与 HLX10 抗体复合物在 312K、39°C、100 ns 条件下的结构信息，并每 50 ns 获取一次 PDB 结构。然而，源站未提供关于数据质量评估、误差范围、验证方法、分辨率、完整性或重复性的具体信息。由于模拟时长和采样间隔有限，结构快照可能无法覆盖更长时间尺度的构象变化。此外，源站未说明模拟力场、溶剂条件、温度控制方式等关键参数，这些因素可能影响数据的适用范围和解释力度。因此，使用者在依赖该数据进行结论推导时，应谨慎考虑上述未提供的信息。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Stan, Razvan，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年，来源站为 doi.org。关于具体的引用格式、许可协议、使用条款、版权归属或分发限制，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时，应参考来源站 doi.org 及 Harvard Dataverse 的相关规定，但源站描述中未给出明确的许可信息。除作者、机构、发布时间和来源站外，源站未提供更多关于引用与许可的细节。