PDB: 5GGT，PD-L1 与 BMS-936559 Fab 复合物（313K，40°C，100 ns）

资源简介

PDB: 5GGT，PD-L1 与 BMS-936559 Fab 复合物（313K，40°C，100 ns）

该数据集围绕 PD-L1 与 BMS-936559 Fab 的复合物展开，提供了在 313K、40°C 条件下 100 ns 的分子动力学模拟轨迹，并每隔 50 ns 输出一帧 PDB 结构。其主题标签覆盖计算机与信息科学、医学健康与生命科学，以及发热、癌症、免疫治疗、炎症和 PD-L1 等方向。数据集由 Stan, Razvan 发布，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年，来源站为 doi.org。整体而言，该数据集可用于研究 PD-L1 与抗体 Fab 的相互作用及构象变化，支撑免疫治疗相关分析，属于肿瘤与癌症总论方向下的结构模拟数据资源。

【数据集背景】

该数据集的主题涉及肿瘤、癌症、免疫治疗、炎症、发热及 PD-L1 等方向。PD-L1 是免疫治疗研究中的重要靶点，其与抗体 Fab 片段的相互作用及构象变化是理解免疫治疗机制的关键环节之一。数据集以 PDB 结构 5GGT 为基础，针对 PD-L1 与 BMS-936559 Fab 的复合物开展模拟，属于肿瘤与癌症总论分类下的结构生物学与计算模拟交叉数据。来源站为 doi.org，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年，作者为 Stan, Razvan。

【数据内容】

数据集英文名为 PDB: 5GGT, PD-L1 in complex with BMS-936559 Fab (313K, 40°C, 100 ns)。其核心内容为 PD-L1 与 BMS-936559 Fab 复合物在 313K、40°C 条件下 100 ns 的模拟结果，并以 PDB 格式每隔 50 ns 输出一帧结构。源站描述为“5GGT, PD-L1 in complex with BMS-936559 Fab (313K, 40°C, 100 ns). PDBs obtained every 50 ns.”。主题标签包括 Computer and Information Science、Medicine, Health and Life Sciences、fever、cancer、immunotherapy、inflammation、PD-L1。

【采集与来源】

数据来源站为 doi.org，机构为 Harvard Dataverse，作者为 Stan, Razvan，发布时间为 2023 年。源站描述指出，该数据对应 5GGT，即 PD-L1 与 BMS-936559 Fab 的复合物，在 313K、40°C 条件下进行 100 ns 模拟，并每隔 50 ns 获取 PDB 结构。除上述信息外，源站未提供更详细的采集设备、模拟软件、力场参数或实验条件说明。

【适用场景】

该数据集可用于研究 PD-L1 与抗体 Fab 的相互作用及构象变化，支撑免疫治疗相关分析。其主题标签涉及肿瘤、癌症、免疫治疗、炎症、发热及 PD-L1 等方向，因此适用于与癌症免疫治疗、PD-L1 靶点结合机制、抗体 Fab 片段识别过程相关的计算与信息学研究。也可用于计算机与信息科学领域中与生物大分子结构模拟、构象采样相关的分析任务。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。已知数据以 PDB 格式每隔 50 ns 输出，使用者可依据 PDB 结构文件开展结构分析与可视化。除源站描述外，未提供关于文件组织、命名规则、读取工具或分析流程的进一步信息。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、模拟收敛性、采样充分性、力场准确性或验证结果的说明。已知模拟时长为 100 ns，输出间隔为 50 ns，温度条件为 313K、40°C。除这些参数外，源站未提供其他质量评估或限制说明。

【引用与许可】

作者为 Stan, Razvan，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年，来源站为 doi.org。除上述信息外，源站未提供具体的引用格式、许可条款或使用限制说明。