PDB: 4ZQK，PD-1 与其配体 PD-L1（310K，37°C，500 ns）：随机种子 #2
数据属于肿瘤/癌症总论分类，涉及免疫治疗、炎症与发热等主题，可用于研究 PD-1/PD-L1 相互作用及免疫检查点相关分析（来源 DOI 解析）
基本信息
资源简介
PDB: 4ZQK，PD-1 与其配体 PD-L1（310K，37°C，500 ns）：随机种子 #2
PDB: 4ZQK 数据集围绕人类程序性死亡受体-1（PD-1）与其配体 PD-L1 的复合物展开，记录了在 310K、37°C 条件下、500 纳秒时间尺度的分子动力学模拟轨迹，对应随机种子 #2。该数据集由作者 Razvan Stan 发布，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年，来源站为 doi.org。其分类归属于肿瘤 / 癌症（总论），主题标签涵盖计算机与信息科学、医学健康与生命科学、发热、癌症、免疫治疗、炎症以及 PD-1。整体而言，该数据集提供了 PD-1/PD-L1 相互作用在特定温度与时间条件下的结构动态信息，可用于免疫检查点相关研究，尤其与免疫治疗、炎症和发热等主题存在关联。
【数据集背景】
PD-1 及其配体 PD-L1 是免疫检查点研究中的关键分子对，在肿瘤免疫逃逸与免疫治疗中具有核心地位。该数据集以人类 PD-1 与 PD-L1 的复合物为对象，在 310K、37°C 的生理相关温度条件下进行 500 纳秒的模拟，并明确标注为随机种子 #2。其分类为肿瘤 / 癌症（总论），主题标签同时涉及免疫治疗、炎症与发热，说明该数据可用于探讨免疫检查点相互作用与肿瘤、炎症及发热相关背景之间的联系。来源站描述指出，该数据对应 PDB 结构 4ZQK 的模拟体系。
【数据内容】
数据集的核心内容是人类 PD-1 与其配体 PD-L1 的复合物在 310K、37°C、500 纳秒条件下的模拟轨迹，随机种子为 #2。根据源站描述，PDB 结构每 50 纳秒获取一次。这意味着在 500 纳秒的模拟过程中，会以 50 纳秒为间隔输出结构快照，从而形成一系列随时间变化的结构样本。数据集名称中明确标注了 PDB: 4ZQK，表明其与 PDB 数据库中的 4ZQK 结构相关。主题标签中的“Computer and Information Science”提示该数据可能涉及计算与信息科学方法，“Medicine, Health and Life Sciences”则表明其面向医学、健康与生命科学领域。
【采集与来源】
该数据集来源于 doi.org，作者为 Razvan Stan，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年。源站描述提供了模拟条件与结构获取方式：310K、37°C、500 纳秒，随机种子 #2，并且 PDB 结构每 50 纳秒获取一次。数据集的分类为肿瘤 / 癌症（总论），主题标签包括 Computer and Information Science、Medicine, Health and Life Sciences、fever、cancer、immunotherapy、inflammation 和 PD-1。除上述信息外，源站未提供更详细的采集设备、模拟软件、力场参数或实验流程说明。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 癌症总论相关研究，尤其是免疫治疗、炎症与发热等主题。由于数据涉及 PD-1/PD-L1 复合物，可用于研究 PD-1 与 PD-L1 的相互作用及免疫检查点相关分析。主题标签中的 immunotherapy 表明其可服务于免疫治疗研究，inflammation 与 fever 则提示其可能与炎症和发热背景下的免疫检查点行为相关。此外，Computer and Information Science 标签说明该数据也可用于计算方法、信息科学或数据驱动的分析场景。整体上，该数据适合用于分子动力学轨迹分析、结构动态比较以及免疫检查点相关的基础研究。
【使用方法】
该数据集以 PDB 结构每 50 纳秒获取一次的方式提供结构样本，因此使用者可按照时间序列对 500 纳秒内的结构变化进行分析。随机种子 #2 表明该数据是特定随机种子下的模拟结果，可用于重复性分析或与其他随机种子的结果进行对比。由于数据名称中标注了 PDB: 4ZQK，使用者可结合该 PDB 标识理解其结构基础。源站未提供具体的文件格式、目录结构、读取工具或分析脚本，因此具体使用方法需依据实际获取的数据文件而定。源站未提供关于软件环境、参数配置或后处理流程的进一步说明。
【质量与限制】
该数据集明确给出了模拟温度 310K、37°C、时长 500 纳秒、随机种子 #2 以及每 50 纳秒获取一次 PDB 结构等条件，这些信息有助于评估数据的一致性与可重复性。然而，源站未提供关于力场、溶剂模型、边界条件、模拟软件、验证方法或误差评估的详细信息。此外，该数据仅对应随机种子 #2，未说明是否包含其他随机种子的重复模拟。因此，在使用时应注意其条件限定，不宜直接外推到其他温度、时间尺度或随机种子。源站未提供关于数据质量、完整性或不确定性的进一步说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Razvan Stan，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2023 年，来源站为 doi.org。数据集英文名称为 PDB: 4ZQK, PD-1 and its ligand PD-L1 (310K, 37°C, 500 ns): random seed #2。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款。如需引用或使用该数据，应依据来源站 doi.org 及 Harvard Dataverse 的相关规定进行确认。源站未提供关于许可类型、署名要求或商业使用限制的进一步信息。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.7910/DVN/AQJPAJ
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.28 GB。
数据说明
Human programmed death-1 (PD-1) in complex with its ligand PD-L1 (310K, 37°C, 500 ns): random seed #2. PDB structures were obtained every 50 ns.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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