MOLI:多组学后期整合深度神经网络药物反应预测数据集

用于药物反应预测的多组学整合数据集,包含CNA和基因表达数据,支持MOLI深度学习模型训练。

School of Computing Science, Simon Fraser University, Burnaby, BC, Canada Vancouver Prostate Centre, Vancouver, BC, CanadaSchool of Computing Science, Simon Fraser University, Burnaby, BC, Canada Vancouver Prostate Centre, Vancouver, BC, Canada
Zenodo
2020-09-18 更新
浏览 31
多组学药物反应预测多组学
MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction

基本信息

模态
多组学
大小
10.44 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2020-09-18

资源简介

MOLI:多组学后期整合深度神经网络药物反应预测数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction》。源站首次发布:2020-09-18。

【数据内容】

源站原始描述:Harmonized data used in "MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction", 2019, Bioinformatics . CNA.tar.gz contains CNA profiles with non-integer estimates of copy number, e.g. log-ratios. Please use binarized CNA profiles (CNA_binary.tar.gz) to replicate the results described in the paper. All raw data were obtained from open sources: - - ArrayExpress - Firehose Broad GDAC - Supplementary of Gao et al., 2015 Gene symbols were mapped to Entrez Gene IDs…

【数据结构与技术规格】

文件数 8 个,合计 10.44 GB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.4036592。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/4036592

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2020-09-19,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/record/4036592

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数据集大小约 10.44 GB。

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