MIDOG 2025挑战数据集

MIDOG 2025挑战数据集包含365例人类、犬、猫12种肿瘤的病理切片图像,用于评估有丝分裂检测模型的泛化能力,涵盖热点、随机和挑战性区域三种采样策略。

弗伦斯堡应用科学大学; 因戈尔施塔特技术大学; 维也纳兽医大学·病理学系; 施瓦茨曼动物医疗中心; 柏林自由大学·兽医病理学研究所; 华威大学·计算机科学系·组织图像分析中心; MINES巴黎·PSL大学·计算生物学中心; 伊斯坦布尔耶尔德兹技术大学·计算机工程系·视觉研究组; 伦敦大学学院·医学物理与生物医学工程系; AIRA MATRIX私人有限公司; Gestalt Diagnostics; 加州大学洛杉矶分校·电气与计算机工程系; 堪萨斯大学医学中心·病理学与检验医学系; 萨莱诺大学·信息与电气工程及应用数学系; 癌症中心有限责任公司; 第十军事研究医院·病理科; 深圳技术大学·健康科学与环境工程学院; 多伦多城市大学·电气计算机与生物医学工程系·医学图像分析实验室; 塔塔咨询服务有限公司·TCS研究中心; 利兹教学医院NHS信托·国家病理学成像合作中心; 东京大学·医学研究生院·放射学与生物医学工程系; 西交利物浦大学·人工智能与高级计算学院; 奥格斯堡大学·应用计算机科学学院·转化医学研究IT基础设施; 乌尔姆大学医学中心·神经病理学研究所; 日本红十字医疗中心·病理科; 弗罗茨瓦夫理工大学·人工智能系; 巴斯克研究与技术联盟·TECNALIA; 印度理工学院孟买分校·机器智能与数据科学中心; 穆罕默德·本·扎耶德人工智能大学; 巴塞尔大学·生物医学工程系·计算与转化病理学实验室; 乌得勒支大学医学中心; 埃因霍温理工大学; 匈牙利科学院生物研究中心·生物化学研究所; 维尔茨堡大学弗伦斯堡应用科学大学; 因戈尔施塔特技术大学; 维也纳兽医大学·病理学系; 施瓦茨曼动物医疗中心; 柏林自由大学·兽医病理学研究所; 华威大学·计算机科学系·组织图像分析中心; MINES巴黎·PSL大学·计算生物学中心; 伊斯坦布尔耶尔德兹技术大学·计算机工程系·视觉研究组; 伦敦大学学院·医学物理与生物医学工程系; AIRA MATRIX私人有限公司; Gestalt Diagnostics; 加州大学洛杉矶分校·电气与计算机工程系; 堪萨斯大学医学中心·病理学与检验医学系; 萨莱诺大学·信息与电气工程及应用数学系; 癌症中心有限责任公司; 第十军事研究医院·病理科; 深圳技术大学·健康科学与环境工程学院; 多伦多城市大学·电气计算机与生物医学工程系·医学图像分析实验室; 塔塔咨询服务有限公司·TCS研究中心; 利兹教学医院NHS信托·国家病理学成像合作中心; 东京大学·医学研究生院·放射学与生物医学工程系; 西交利物浦大学·人工智能与高级计算学院; 奥格斯堡大学·应用计算机科学学院·转化医学研究IT基础设施; 乌尔姆大学医学中心·神经病理学研究所; 日本红十字医疗中心·病理科; 弗罗茨瓦夫理工大学·人工智能系; 巴斯克研究与技术联盟·TECNALIA; 印度理工学院孟买分校·机器智能与数据科学中心; 穆罕默德·本·扎耶德人工智能大学; 巴塞尔大学·生物医学工程系·计算与转化病理学实验室; 乌得勒支大学医学中心; 埃因霍温理工大学; 匈牙利科学院生物研究中心·生物化学研究所; 维尔茨堡大学
arXiv
2026-06-05 更新
浏览 33
医学影像mitotic figure detectionatypical mitosis classificationcomputational pathologywhole slide imagesbreast cancercanine cancerMICCAIchallenge
MIDOG 2025 Challenge Dataset

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-06-05

资源简介

MIDOG 2025挑战数据集

【一句话概览】

MIDOG 2025 会议论文集已作为 Springer LNCS 的一部分正式发布,官方链接为 https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-032-25180-0。主办方对所有作者表示祝贺,并感谢大家共同成就了这次挑战赛与研讨会。该活动涉及有丝分裂象检测、非典型有丝分裂分类、计算病理学、全切片图像、乳腺癌、犬类癌症等主题,并与 MICCAI 及挑战赛相关(来源 midog2025.deepmicroscopy.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《MIDOG 2025》。

【数据内容】

源站原始描述:MIDOG 2025 proceedings It is our great pleasure to announce the availability of the official MIDOG 2025 proceedings as part of Springers LNCS: . Congratulations to all authors and thanks for making it a great challenge and workshop!

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):MIDOG 2025 会议论文集 我们非常高兴地宣布,MIDOG 2025 官方会议论文集已作为 Springer LNCS 的一部分正式发布:https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-032-25180-0 。祝贺所有作者,并感谢大家共同成就了这一精彩的挑战赛和研讨会!

【主题与分类】

主题标签:mitotic figure detection、atypical mitosis classification、computational pathology、whole slide images、breast cancer、canine cancer、MICCAI、challenge。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://midog2025.deepmicroscopy.org

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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://midog2025.deepmicroscopy.org

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集由弗伦斯堡应用科学大学等多家国际机构联合创建,用于评估有丝分裂检测模型的领域泛化能力。包含365个独立病例的感兴趣区域,涵盖人类、犬类和猫类共12种肿瘤类型,通过多种扫描平台数字化获取,并引入热点区域、随机区域和挑战性区域三种采样策略。数据由病理学专家手动标注,旨在解决传统模型在生物多样性和复杂组织背景下性能下降的问题,推动计算病理学自动化有丝分裂计数技术的临床转化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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