GSE308836：53BP1凝聚体调控异染色质DNA复制完成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308836

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表观遗传沉默的异染色质在细胞周期的一个特定窗口期进行复制；然而，控制异染色质复制完成的机制仍不清楚。在此，我们通过质谱分析P53结合蛋白1（53BP1）凝聚体中富集的因子，报道53BP1深度参与调控异染色质处DNA复制和表观遗传标记恢复的复合物。53BP1耗竭导致异染色质处表观遗传因子的募集减少、DNA复制后异染色质表观遗传标记恢复受损，并延长异染色质复制。这些缺陷可被野生型或具备凝聚体形成能力的53BP1挽救，而不能被凝聚体形成缺陷型53BP1挽救。53BP1的凝聚体形成及其对异染色质复制的调控需要其与增殖细胞核抗原（PCNA）的相互作用。此外，与PCNA的相互作用介导53BP1从凝聚体向DNA损伤修复的转变。总之，我们的结果支持53BP1凝聚体在调控异染色质复制完成中发挥重要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。