104种化合物在六种永生化与四种原代细胞系中的扰动单细胞RNA测序
该数据集为扰动性单细胞RNA测序数据，涵盖六种永生化细胞系（A549、A375、H1AE、HEK293T、HEP2G、PC3）和四种原代细胞（CD8+ T细胞、CD34+造血祖细胞、原代脂肪细胞PAD、支气管上皮细胞HBEC）
基本信息
资源简介
104种化合物在六种永生化与四种原代细胞系中的扰动单细胞RNA测序
Perturbational single-cell RNA sequencing of 104 compounds across six immortalized and four primary cell lines
该数据集为扰动性单细胞RNA测序数据，涵盖六种永生化细胞系（A549、A375、H1AE、HEK293T、HEP2G、PC3）和四种原代细胞（CD8+ T细胞、CD34+造血祖细胞、原代脂肪细胞PAD、支气管上皮细胞HBEC）。104种化合物（含88种来自CMap）在10种细胞类型中重复测试并设文库匹配对照，共产生1,737个scRNA-seq样本、总计1.26 M细胞。可用于研究化合物扰动下的细胞转录组响应、药物作用机制及细胞类型特异性反应（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Aug 25 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们介绍一个新的扰动性scRNA-seq数据集，包括六种永生化细胞系（A549、A375、H1AE、HEK293T、HEP2G和PC3）和四种原代细胞系：CD8+ T细胞（CD8+）、CD34+造血祖细胞（CD34+）、原代脂肪细胞（PAD）和支气管上皮细胞（HBEC）。104种化合物，其中88种来自CMap，在10种细胞类型中重复测试并设文库匹配对照，共产生1,737个scRNA-seq样本，总计1.26 M细胞。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL21697、9606。本站分类：肿瘤/癌症（总论）。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306429
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 03 202，引用时请注意版本时效。
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306429
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们介绍了一个新的扰动单细胞RNA测序数据集，其中包括六种永生化细胞系（A549、A375、H1AE、HEK293T、HEP2G和PC3）以及四种原代细胞系：CD8+ T细胞（CD8+）、CD34+造血祖细胞（CD34+）、原代脂肪细胞（PAD）和支气管上皮细胞（HBEC）。在10种细胞类型中，对104种化合物（包括来自CMap的88种）进行了测试，每种化合物均设文库匹配对照并做双重复，最终获得了1，737个单细胞RNA测序样本，共计1，260，000个细胞。
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