通用医学人工智能/切片对话

该仓库提供SlideChat全切片病理图像理解的训练与评估数据集,含指令跟随训练数据及VQA/Caption评估基准。引言 本仓库提供了用于训练和评估 SlideChat 的数据集资源,SlideChat 是一个用于全切片病理图像理解的多模态大语言模型

huggingface
2026-09-05 更新
浏览 17
图像分类size_categories:100K<n<1Mmodality:textregion:us
General-Medical-AI/SlideChat

基本信息

模态
图像
大小
302.579490412 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-09-05

资源简介

通用医学人工智能/切片对话

General-Medical-AI/SlideChat

该仓库提供SlideChat全切片病理图像理解的训练与评估数据集,含指令跟随训练数据及VQA/Caption评估基准。训练数据分两阶段:切片级caption和切片级VQA指令数据;SlideBench含TCGA、CPTAC、Histai的caption/report拆分及TCGA、BCNB、CPTAC、Histai的闭集VQA拆分。共550个文件(来源 Hugging Face)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024-11-07。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):## 引言 本仓库提供了用于训练和评估 SlideChat 的数据集资源,SlideChat 是一个用于全切片病理图像理解的多模态大语言模型。该数据集包含指令遵循训练数据,以及跨多个病理队列和任务的 VQA/描述评估基准。 内容 1. 训练指令数据 SlideInstruct_train_stage1_caption.json:用于第 1 阶段训练的切片级描述指令数据。 SlideInstruct_train_stage2_vqa.json:用于第 2 阶段训练的切片级 VQA 指令数据。 2. 评估基准(SlideBench) SlideBench-Caption-.csv:TCGA、CPTAC 和 Histai 队列的描述/报告评估划分。 SlideBench-VQA-.csv:TCGA、BCNB、CPTAC 和 Histai 队列的封闭式 VQA 评估划分。

【数据结构与技术规格】

文件数 550 个,合计 267.51 GB。

【主题与分类】

本站分类:肿瘤/癌症(总论)。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/General-Medical-AI/SlideChat

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-09-05,引用时请注意版本时效。

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暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("General-Medical-AI/SlideChat")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install && git clone https://hf-mirror.com/datasets/General-Medical-AI/SlideChat

数据集大小约 302.58 GB。

仓库文件结构

  • .gitattributes
  • README.md
  • SlideBench-Caption-CPTAC.csv
  • SlideBench-Caption-Histai.csv
  • SlideBench-Caption-TCGA.csv
  • SlideBench-VQA-BCNB.csv
  • SlideBench-VQA-CPTAC.csv
  • SlideBench-VQA-Histai.csv
  • SlideBench-VQA-TCGA.csv
  • SlideInstruct_train_stage1_caption.json
  • SlideInstruct_train_stage2_vqa.json
  • SlideInstruction++.json
  • SlideInstruction+.json

数据集卡片摘录(源站说明)

Introduction

This repository provides the dataset resources used for training and evaluating SlideChat, a multimodal large language model for whole-slide pathology image understanding.

The dataset includes both instruction-following training data and VQA/Caption evaluation benchmarks across multiple pathology cohorts and tasks.

Contents

  1. Training Instruction Data

SlideInstruct_train_stage1_caption.json: Slide-level caption instruction data used for Stage-1 training.

SlideInstruct_train_stage2_vqa.json: Slide-level VQA instruction data used for Stage-2 training.

  1. Evaluation Benchmarks (SlideBench)

SlideBench-Caption-*.csv: Caption/Report evaluation splits for TCGA, CPTAC and Histai cohorts.

SlideBench-VQA-*.csv: Closed VQA evaluation splits for TCGA, BCNB, CPTAC, and Histai cohorts.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

完整数据卡:huggingface.co/datasets/General-Medical-AI/SlideChat

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