GADVR

GADVR数据集是首个像素级视觉推理数据集,用于胃癌亚型诊断,包含图像块和文本配对。

哈尔滨工业大学,德国莱布尼茨分析科学研究所,中山大学附属第六医院,埃森大学医院病理研究所,德国北莱茵-威斯特法伦州文化科学部,德国联邦教育和研究部,中国国家自然科学基金委员会哈尔滨工业大学,德国莱布尼茨分析科学研究所,中山大学附属第六医院,埃森大学医院病理研究所,德国北莱茵-威斯特法伦州文化科学部,德国联邦教育和研究部,中国国家自然科学基金委员会
arXiv
2025-08-28 更新
浏览 13
医学影像, 文本胃癌医学影像

基本信息

模态
医学影像, 文本
创建/更新时间
2025-08-28

资源简介

GADVR数据集是首个像素级视觉推理数据集,包含约19万个图像块和55万配对图像-文本条目,基于PatchGastricADC22构建,提供像素级细胞核分割和分类标签及细胞级问答对,用于胃癌亚型诊断。

原始链接

https://github.com/zhangye-zoe/PathMR

arXiv 论文 →
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使用方式

数据集获取

git clone https://github.com/zhangye-zoe/PathMR.git

curl -L -o repo.zip https://github.com/zhangye-zoe/PathMR/archive/refs/heads/main.zip
unzip repo.zip

源站 README 摘录(使用方式)

📦 Installation

  1. Clone this repository
git clone https://github.com/zhangye-zoe/PathMR.git
cd PathMR

  1. To install requirements using conda environment
conda env create -n [env name] -f M2SA.yaml
conda activate [env name]
pip install flash-attn no-build-isolation

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

完整仓库:github.com/zhangye-zoe/PathMR

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