dragen 4.2.4 HG008肿瘤体细胞变异注释数据集

HG008肿瘤样本体细胞变异经ANNOVAR注释后的VCF文件,用于肿瘤基因组分析。

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DataCite Commons
2025-06-01 更新
浏览 9
基因组cancercancer genomicsHG008-Tsomatic variant annotation
dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.hg38_multianno_clinvar.vcf.gz

基本信息

模态
基因组
大小
0.005057454 GB
许可
CC0
创建/更新时间
2025-06-01
版本
v2

资源简介

dragen 4.2.4 HG008肿瘤体细胞变异注释数据集

【一句话概览】

本数据集是 figshare 公开的组学数据集,收录 1 个文件、合计 5.06 MB,主题涵盖 cancer、cancer genomics、HG008-T、somatic variant annotation,可用于生物标志物发现与分子分型研究,CC0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.hg38_multianno_clinvar.vcf.gz》。源站首次发布:2025-04-30。

【数据内容】

源站原始描述:Initial annotation of a publicly available HG008-T somatic variants called by DRAGEN v.4.2.4 ( was performed using ANNOVAR (v2020-06-08

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):使用 ANNOVAR(v2020-06-08,https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/)对由 DRAGEN v.4.2.4 检出的公开可用 HG008-T 体细胞变异(https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ReferenceSamples/giab/data_somatic/HG008/Liss_lab/superseded-2022-data/analysis/DRAGEN-v4.2.4_ILMN-WGS_20230914/dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.vcf.gz)进行了初步注释。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 5.06 MB。dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.hg38_multianno_clinvar.vcf.gz:application/x-gzip,5.06 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.28904696.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Genomics and transcriptomics。主题标签:cancer、cancer genomics、HG008-T、somatic variant annotation。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/dragen_4_2_4_HG008_tumor_hard-filtered_hg38_multianno_clinvar_vcf_gz/28904696

使用许可:CC0(https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/)。

规范引用:McDaniel, Jennifer; Zook, Justin (2025). dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.hg38_multianno_clinvar.vcf.gz. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.hg38_multianno_clinvar.vcf.gz" "https://ndownloader.figshare.com/files/54098843"

文件清单

  • dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.hg38_multianno_clinvar.vcf.gz(5.06 MB)

文件总体积 5.06 MB(源站 API 实测)。

数据说明

Initial annotation of a publicly available HG008-T somatic variants called by DRAGEN v.4.2.4 (https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ReferenceSamples/giab/data_somatic/HG008/Liss_lab/superseded-2022-data/analysis/DRAGEN-v4.2.4_ILMN-WGS_20230914/dragen_4.2.4_HG008_tumor.hard-filtered.vcf.gz) was performed using ANNOVAR (v2020-06-08, https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/).

许可

CC0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.28904696.v2(source: https://figshare.com/articles/dataset/dragen_4_2_4_HG008_tumor_hard-filtered_hg38_multianno_clinvar_vcf_gz/28904696)。

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