癌症依赖图谱（CCLE）
1,600+ 癌细胞系基因依赖图谱（CRISPR/RNAi 筛选 + 组学），肿瘤药敏/依赖标杆，季度公开版本下载。1,600+ cancer cell line dependency screens.
基本信息
资源简介
癌症依赖图谱（CCLE）
DepMap: Cancer Dependency Map (CCLE) 是一个围绕癌细胞系构建的基因依赖图谱资源，来源网站为 depmap.org，在所属站点分类中位于肿瘤/其他。按来源描述，它覆盖 1,600+ 癌细胞系，整合 CRISPR/RNAi 筛选与组学，被定位为肿瘤药敏/依赖标杆，并按季度公开版本提供下载。
【数据集背景】
该资源的英文名称为 DepMap: Cancer Dependency Map (CCLE)，来源网站是 depmap.org，站点分类为肿瘤/其他。与其相关的主题词包括 cancer cell line、CRISPR、dependency、CCLE。它被描述为 1,600+ 癌细胞系基因依赖图谱，并强调 CRISPR/RNAi 筛选与组学，同时被称为肿瘤药敏/依赖标杆，提供季度公开版本下载。关于项目发起背景、维护团队、历史沿革、版本命名、资助来源、合作机构等更完整的背景信息，源站未提供。
【数据内容】
从来源描述看，该数据集的核心内容是 1,600+ 癌细胞系基因依赖图谱。来源描述同时指出，其数据构成涉及 CRISPR/RNAi 筛选与组学，并以“1,600+ cancer cell line dependency screens.”作为英文说明。相关主题词包括 cancer cell line、CRISPR、dependency、CCLE。可确认的是，它围绕癌细胞系、基因依赖、CRISPR/RNAi 筛选和组学展开。至于具体包含哪些癌细胞系、覆盖哪些癌种、包含哪些基因、有哪些筛选类型、组学层级如何组织、数据表字段和元数据字典如何设计，源站未提供。
【采集与来源】
该资源来源网站为 depmap.org。来源描述提到 CRISPR/RNAi 筛选与组学，说明其内容与这些筛选和组学信息相关；同时提到季度公开版本下载。关于数据采集的具体实验流程、样本来源、筛选平台、组学平台、质控步骤、版本发布周期细节、下载入口、文件格式、版本号、是否需要注册或申请，源站未提供。
【适用场景】
来源描述将该资源定位为肿瘤药敏/依赖标杆。因此，它适合与肿瘤药敏、肿瘤基因依赖、癌细胞系研究相关的了解、检索和参考场景；主题词 cancer cell line、CRISPR、dependency、CCLE 也表明其关联方向包括癌细胞系、CRISPR 筛选和依赖分析。关于具体可支持的药敏预测、靶点发现、生物标志物分析、联合用药分析等细分场景，以及配套分析工具和案例，源站未提供。
【使用方法】
来源描述提到季度公开版本下载。因此，使用者可按公开版本获取该资源。关于下载后的数据处理、文件读取、数据库查询、API 调用、数据字典、分析流程、软件环境、版本差异处理等操作方法，源站未提供。
【质量与限制】
关于该资源的质量评估、数据完整性、批次效应、偏差控制、更新差异、已知限制、使用禁忌、适用边界等，源站未提供。可确认的是，它被描述为 1,600+ 癌细胞系基因依赖图谱，涉及 CRISPR/RNAi 筛选与组学，并被定位为肿瘤药敏/依赖标杆，按季度公开版本下载；除此之外的质量与限制信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于引用格式、许可协议、商业使用条件、再分发限制、署名要求、版权归属等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://depmap.org/portal/download
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
1,600+ 癌细胞系基因依赖图谱（CRISPR/RNAi 筛选 + 组学），肿瘤药敏/依赖标杆，季度公开版本下载。1,600+ cancer cell line dependency screens.
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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