临床知识库
临床知识库是收录肿瘤学基因/变异注释、治疗知识和临床试验的半自动手工数据库。
基本信息
模态
表格
创建/更新时间
2026-10-19
资源简介
临床知识库（Clinical Knowledgebase，简称CKB）前身为杰克逊临床知识库，是一款经半自动化与人工精编的数据库，收录与肿瘤学相关的基因/变异注释、治疗学知识、诊断及预后信息，以及各类临床试验数据。CKB不仅涵盖体细胞基因变异的蛋白质效应相关最新信息，还通过疗效证据注释将变异与靶向治疗方案建立关联。此外，该知识库还收录了包含基因组改变（基因型特异性）的临床试验患者入组标准。其公共访问版本CKB CORE包含50个肿瘤相关基因，且每季度会轮换一组选定基因，聚焦特定主题；用户可通过基因及基因变异对CKB CORE进行检索。基于网页的订阅版CKB BOOST可用于针对特定数据属性查询知识库，同时在用户不确定所需内容时，提供功能完善的类浏览功能。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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