CGCI-BLGSP受控测序数据

dbGaP phs000527 是 CGCI-BLGSP 的受控访问研究页面,包含伯基特淋巴瘤测序和临床相关数据说明。由National Cancer Institute提供,包含多种数据模态,包含323条数据记录,适用于分类任务,许可证为NIH Genomic Data Sharing Policy。

National Cancer InstituteNational Cancer Institute
dbGaP
浏览 16
多模态分类Burkitt LymphomaNon-Hodgkin LymphomaCancer GenomicsWhole Exome SequencingTranscriptome AnalysisPediatricAdultHIV-positiveCGCIBLGSP
dbGaP phs000527 BLGSP

基本信息

模态
多模态
数据量
323
任务类型
分类
许可
NIH Genomic Data Sharing Policy
创建/更新时间
2026-09-28

资源简介

CGCI-BLGSP受控测序数据

【一句话概览】

美国国家癌症研究所癌症基因组学办公室发起癌症基因组特征计划(CGCI),评估新兴测序技术在癌症中的应用。伯基特淋巴瘤基因组测序项目(BLGSP)由该研究所与伯基特淋巴瘤研究基金会合作开展,纳入323名受试者,涵盖成人及儿童散发性、地方性和HIV阳性散发性伯基特淋巴瘤患者,通过DNA和RNA测序分析肿瘤基因组与转录组改变,旨在发现分子变化及其与治疗方案和结果的关系,数据存于NCI基因组数据共享平台(来源 NCBI)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《National Cancer Institute (NCI) Cancer Genome Characterization Initiative (CGCI): Burkitt Lymphoma Genome Sequencing Project (BLGSP)》。

【数据内容】

源站原始描述:The Office of Cancer Genomics at the National Cancer Institute sponsored a series of studies as part of the Cancer Genome Characterization Initiative (CGCI) to assess novel emerging sequencing technologies in cancer. The CGCI program included comprehensive characterization of the genetic aberrations found in different pediatric and/or adult tumors. All data from these projects is available at the NCI Genomic Data Commons . The Burkitt Lymphoma Genome Sequencing Project (BLGSP) was a collaborativ…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):美国国家癌症研究所癌症基因组学办公室(Office of Cancer Genomics)资助了一系列研究,作为癌症基因组特征描述计划(Cancer Genome Characterization Initiative, CGCI)的一部分,旨在评估癌症领域中新兴的测序技术。CGCI计划包括对不同儿童和/或成人肿瘤中发现的基因畸变进行全面特征描述。这些项目的所有数据均可在NCI基因组数据共享平台(NCI Genomic Data Commons)获取。伯基特淋巴瘤基因组测序项目(Burkitt Lymphoma Genome Sequencing Project, BLGSP)是美国国家癌症研究所与伯基特淋巴瘤研究基金会(Foundation for Burkitt Lymphoma Research)的合作项目,旨在建立一个数据库,收录伯基特淋巴瘤(Burkitt lymphoma, BL)中发现的众多变异。伯基特淋巴瘤是一种不常见的非霍奇金淋巴瘤,最常发生于儿童和年轻成人。目前针对BL的化疗方案对约40-90%的患者有效,具体取决于年龄、疾病分期、治疗方案以及治疗机构的所在地。因此,需要新的治疗方法来提高当前方案的疗效,并有可能用毒性较低的药物替代目前使用的高强度化疗药物。CGCI BLGSP研究的目标是探索BL患者中可能存在的遗传变化,从而为更好地预防、检测和治疗该癌症提供依据。OCG基于在管理其他重大癌症基因组学项目中积累的经验,为本项目的实施提供了所需的行政和分析基础设施。BLGSP研究纳入了散发性BL的成人和儿童患者,以及地方性和HIV阳性散发性BL患者。BLGSP的第一个主要目标是通过精确的方案,从数量相对较多、临床注释完善的BL病例中采集肿瘤组织及患者匹配的对照组织。第二个目标是通过对每个病例的DNA和RNA进行测序,对肿瘤基因组(以匹配的正常组织作为对照…

【主题与分类】

主题标签:Burkitt Lymphoma、Non-Hodgkin Lymphoma、Cancer Genomics、Whole Exome Sequencing、Transcriptome Analysis、Pediatric、Adult、HIV-positive、CGCI、BLGSP。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000527.v18.p6

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000527.v18.p6

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

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