人原发乳腺肿瘤及MDA-MB-231亚群转录谱分析
该数据集包含人原发乳腺肿瘤及MDA-MB-231细胞亚群的转录谱数据。MDA-MB-231亚群在注射到免疫缺陷小鼠后表现出不同的转移倾向；同时还包括一组在Memorial Sloan-Kettering Cancer Center（MSKCC）手术切除的原发乳腺癌样本
基本信息
资源简介
人原发乳腺肿瘤及MDA-MB-231亚群转录谱分析
该数据集为转录组学数据集，英文名称为“Transcription profiling of human primary breast tumors and MDA-MB-231 subpopulations”，在肿瘤/乳腺癌分类下收录，来源站为omicsdi.org。数据集同时涵盖两类样本的转录谱：一是人原发乳腺肿瘤，二是在注射到免疫缺陷小鼠后表现出不同转移倾向的MDA-MB-231细胞亚群；此外还包括一组在Memorial Sloan-Kettering Cancer Center（MSKCC）手术切除的原发乳腺癌样本。主题标签为Transcriptomics。整体而言，该数据集围绕乳腺癌原发肿瘤与具有不同转移倾向的细胞亚群展开转录层面的刻画，可用于比较不同样本群体在基因表达层面的差异，为理解乳腺癌转移相关生物学特征提供转录组数据基础。
【数据集背景】
乳腺癌是肿瘤研究中的重要对象，转移倾向的差异是理解疾病进展的关键问题之一。该数据集将人原发乳腺肿瘤与MDA-MB-231细胞亚群并列纳入转录谱研究：MDA-MB-231亚群在注入免疫缺陷小鼠后表现出不同的转移倾向，而原发肿瘤样本则来自临床手术切除的乳腺癌组织。这种将细胞亚群模型与临床原发肿瘤样本结合的设置，使数据集能够在转录组层面同时覆盖实验模型与临床样本两类对象，服务于对乳腺癌转移相关表达特征的考察。
【数据内容】
数据集的核心内容是转录谱数据，覆盖人原发乳腺肿瘤以及MDA-MB-231细胞亚群。MDA-MB-231亚群的特征在于注射到免疫缺陷小鼠后表现出不同的转移倾向，因此其转录谱可用于比较不同亚群之间的表达差异。数据集还包含一组在Memorial Sloan-Kettering Cancer Center（MSKCC）手术切除的原发乳腺癌样本，构成临床原发肿瘤的转录谱部分。主题标签为Transcriptomics，表明数据属于转录组学范畴。关于具体的样本数量、测序平台、表达矩阵格式、基因注释版本等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为omicsdi.org。样本来源包括两方面：一是MDA-MB-231细胞亚群，其在免疫缺陷小鼠中表现出不同的转移倾向；二是在Memorial Sloan-Kettering Cancer Center（MSKCC）手术切除的原发乳腺癌样本。关于样本采集的具体时间、伦理审批信息、手术切除样本的临床病理信息、细胞亚群的建立与培养条件等，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于转录组学层面的乳腺癌研究场景，例如比较MDA-MB-231不同转移倾向亚群之间的基因表达差异，或将原发乳腺肿瘤样本的转录谱与细胞亚群数据结合进行表达特征分析。主题标签Transcriptomics也表明其可用于转录组相关的数据探索。关于具体的分析任务设计、统计方法或验证实验，源站未提供。
【使用方法】
数据集以转录谱数据形式提供，使用时应围绕人原发乳腺肿瘤与MDA-MB-231亚群两类样本进行组织与分析。关于数据下载方式、文件格式、预处理流程、标准化方法及分析工具等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集包含临床手术切除的原发乳腺癌样本与实验细胞亚群两类材料，样本来源明确。但关于数据质量评估指标、批次效应处理、样本量、缺失值情况以及结果的可推广性等，源站未提供。使用时应结合源站信息进一步核实数据细节。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-2603
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Subpopulations of MDA-MB-231 that exhibit different metastatic tropisms when injected into immuno-deficient mice. Also, a cohort of primary breast cancers surgically resected at the Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC).
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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