miR-335表达载体转导人LM2细胞与对照的转录谱分析
该数据集来自omicsdi.org，属于肿瘤/乳腺癌分类，主题标签为Transcriptomics。数据涉及人LM2乳腺癌细胞系，该细胞系源自MDA-MB-231亲本系的体内衍生株，分别转导短发夹对照载体或miR-335表达载体后进行转录谱分析
基本信息
资源简介
miR-335表达载体转导人LM2细胞与对照的转录谱分析
该数据集为转录组学（Transcriptomics）研究数据，收录于omicsdi.org，归入肿瘤/乳腺癌分类。数据集全称为“Transcription profiling of human LM2 cells transduced with miR-335 expression vector vs. control”，即对人LM2细胞分别转导miR-335表达载体与对照载体后的转录谱进行比较分析。LM2是一种乳腺癌细胞系，为MDA-MB-231亲本系的体内衍生株。实验设计中，LM2细胞被转导短发夹对照载体或miR-335表达载体，随后开展转录谱检测，以比较两组细胞在转录水平上的差异。该数据集围绕miR-335在乳腺癌细胞中的表达效应，提供了可用于转录组比较分析的数据资源，主题聚焦于转录组学，适用于乳腺癌相关的基础研究场景。
【数据集背景】
该数据集属于肿瘤/乳腺癌分类，主题标签为Transcriptomics，来源于omicsdi.org。研究对象为人LM2乳腺癌细胞系。LM2细胞系是MDA-MB-231亲本系的体内衍生株，这一背景使其区别于常规体外培养的乳腺癌细胞模型。数据集的核心设计在于对LM2细胞进行两种不同载体的转导：一种为短发夹对照载体，另一种为miR-335表达载体，进而通过转录谱分析比较两组细胞的基因表达特征。该设计旨在从转录组层面观察miR-335表达载体转导所带来的表达变化，为理解miR-335在乳腺癌细胞中的作用提供数据基础。
【数据内容】
数据集的内容为转录谱（transcription profiling）数据，比较转导miR-335表达载体的LM2细胞与转导短发夹对照载体的LM2细胞。实验涉及两种转导条件：短发夹对照载体与miR-335表达载体。数据主题标签为Transcriptomics，表明其属于转录组学范畴。关于具体样本数量、检测平台、基因数量、表达矩阵格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。源站描述指出，LM2乳腺癌细胞系为MDA-MB-231亲本系的体内衍生株；该LM2细胞系被转导短发夹对照载体或miR-335表达载体。实验总体设计即为：LM2细胞系分别转导短发夹对照载体或miR-335表达载体。关于样本采集的具体流程、培养条件、转导方法细节、测序或芯片平台信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关的比较分析场景，尤其是围绕乳腺癌细胞系中miR-335表达效应的研究。由于数据比较的是转导miR-335表达载体与短发夹对照载体的LM2细胞，可用于观察两组之间转录谱差异的分析工作。其肿瘤/乳腺癌分类与Transcriptomics标签也使其可归入乳腺癌转录组数据资源中，供相关基础研究参考。关于具体的下游分析类型、验证实验设计或临床转化用途，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可用于比较miR-335表达载体转导组与短发夹对照载体转导组的转录谱。使用时应以对照载体组为参照，分析miR-335表达载体组中转录本表达的变化。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、归一化方法及分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于LM2细胞系，该细胞系为MDA-MB-231亲本系的体内衍生株，实验设计为对照载体与miR-335表达载体的两组比较。关于数据质量评估指标、重复数、批次效应、测序深度或芯片信号质量等信息，源站未提供。使用时应注意到数据集仅涵盖上述两种转导条件的比较，其他条件或细胞背景未在源站描述中体现。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可信息，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-9586
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
LM2乳腺癌细胞系是源自MDA-MB-231亲本系的体内衍生细胞系。该LM2细胞系已被转导了短发夹对照载体或miR-335表达载体。实验总体设计：LM2细胞系被转导了短发夹对照载体或miR-335表达载体。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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