芳香化酶抑制剂治疗前后人乳腺癌活检组织的转录组分析
该数据集来自 omicsdi.org,收录了人乳腺癌活检组织的转录组分析数据,样本取自患者接受芳香化酶抑制剂治疗前后的配对活检

基本信息
资源简介
芳香化酶抑制剂治疗前后人乳腺癌活检组织的转录组分析
该数据集聚焦于人类乳腺癌患者在芳香化酶抑制剂治疗前后的转录组变化,属于肿瘤学中乳腺癌方向的分子表达谱研究。其英文名称为“Transcription profiling of human breast cancer biopsies taken before and after patients were treated with aromatase inhibitors”,表明研究核心是对接受芳香化酶抑制剂治疗的患者,采集治疗前后的乳腺活检组织,并进行转录组层面的分析。数据来源站为 omicsdi.org,源站将其描述为“Molecular response to Aromatase Inhibitor Treatment in Primary Breast Cancer”,主题标签为 Transcriptomics。整体来看,该数据集旨在从基因表达角度呈现原发性乳腺癌对芳香化酶抑制剂治疗的分子响应,为理解内分泌治疗机制和潜在生物标志物提供转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
该数据集所涉及的背景是原发性乳腺癌的芳香化酶抑制剂治疗。芳香化酶抑制剂是乳腺癌内分泌治疗中的一类重要药物,其作用与抑制雌激素合成相关,常用于激素受体阳性的乳腺癌患者。源站描述为“Molecular response to Aromatase Inhibitor Treatment in Primary Breast Cancer”,说明该数据集关注的是原发性乳腺癌在接受芳香化酶抑制剂治疗后的分子响应。通过比较患者治疗前后的活检组织转录组,可以观察治疗干预在基因表达层面引起的变化。该数据集被归类为肿瘤 / 乳腺癌,主题标签为 Transcriptomics,表明其属于转录组学范畴,服务于乳腺癌分子机制与治疗响应研究。
【数据内容】
该数据集的内容为人类乳腺癌活检组织的转录组分析数据。样本来自患者接受芳香化酶抑制剂治疗前后的配对活检,即同一患者具有治疗前和治疗后两个时间点的活检样本,可用于配对比较。数据主题标签为 Transcriptomics,说明其核心数据类型是转录组层面的表达信息。源站描述强调“Molecular response to Aromatase Inhibitor Treatment in Primary Breast Cancer”,进一步表明数据内容围绕原发性乳腺癌对芳香化酶抑制剂治疗的分子响应展开。除上述信息外,关于具体样本数量、基因数量、检测平台、表达矩阵格式、差异表达结果等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。样本采集对象为人类乳腺癌患者,采集材料为乳腺活检组织,采集时间点包括患者接受芳香化酶抑制剂治疗之前和之后。源站描述为“Molecular response to Aromatase Inhibitor Treatment in Primary Breast Cancer”,说明采集背景是原发性乳腺癌的芳香化酶抑制剂治疗。数据主题标签为 Transcriptomics,表明其采集和分析方向为转录组学。关于具体的采集机构、伦理审批信息、患者入组标准、活检部位、治疗药物种类与剂量、治疗持续时间、样本处理流程、测序或芯片平台等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于乳腺癌内分泌治疗相关的转录组研究场景。例如,可用于探索芳香化酶抑制剂治疗前后基因表达变化,寻找与治疗响应相关的候选基因或表达特征;也可用于原发性乳腺癌分子响应机制的研究,以及转录组层面的配对样本分析。由于数据涉及治疗前后配对活检,适合开展同一患者自身对照的表达比较研究。该数据集还可作为乳腺癌转录组数据整合分析的组成部分,用于方法学验证、生物标志物假设生成等。但具体适用性仍需结合源站未提供的平台信息、样本量和临床注释等因素判断。
【使用方法】
该数据集的使用应围绕治疗前后配对活检的转录组数据展开。一般可先获取数据文件,确认其转录组数据类型与样本对应关系,然后按照治疗前与治疗后进行配对分组,开展表达差异分析、通路富集分析或分子响应模式分析。由于样本来自同一患者的配对活检,分析时宜考虑配对设计,以减少个体间差异带来的影响。若数据包含临床注释,可进一步结合治疗响应等信息进行分组比较。关于具体下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法、分析工具和代码等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 omicsdi.org,源站描述为“Molecular response to Aromatase Inhibitor Treatment in Primary Breast Cancer”,主题标签为 Transcriptomics。其潜在优势在于采用治疗前后配对活检,能够直接反映芳香化酶抑制剂治疗相关的转录组变化。但关于样本量、测序深度、平台版本、数据完整性、批次效应、临床随访信息、治疗响应定义、质量控制指标等,源站未提供。因此,使用该数据集时需注意其适用范围可能受限于源站未提供的技术细节和临床背景,不宜在缺乏验证的情况下直接推广到其他乳腺癌人群或治疗场景。
【引用与许可】
该数据集来源站为 omicsdi.org。关于引用方式、原始文献、作者列表、发表期刊、DOI、数据许可协议、使用限制和商业使用条件等,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应自行查阅来源站及相关原始数据页面以确认具体引用要求和许可条款。
下载信息
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暂未开放公开下载
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-TABM-180
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Molecular response to Aromatase Inhibitor Treatment in Primary Breast Cancer
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




