雌激素调控卵巢癌生长与转移的组织特异性通路

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-22600

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

绝经后雌激素（E2）替代治疗会增加雌激素受体（ER）阳性上皮性卵巢癌（EOC）的风险。E2是致瘤还是促进未确诊的已有疾病扩展尚不清楚。为了确定E2对肿瘤促进的作用，我们使用ZsGreen荧光ER- 2008和ER+ PEO4人EOC细胞开发了一种腹腔内小鼠异种移植模型。通过体内荧光成像量化肿瘤生长。在ER+肿瘤中，E2显著增加大小，诱导孕激素受体，并促进淋巴结转移，证实ER具有功能性并促进侵袭性。从ER-和ER+异种移植肿瘤中激光捕获的人EOC细胞被分析E2调节基因的表达。定义了三类E调节的EOC基因，但不到10%与E调节的乳腺癌基因共享。由于乳腺癌选择性ER调节剂（SERM）在EOC中治疗无效，我们建议我们的EOC特异性E调节基因可以帮助发现卵巢靶向SERM的药物。

本实验采用2x2析因设计，包含15个样本，涉及2种不同的细胞系（2008和PEO4）及2种不同的激素处理（E代表雌激素，C代表安慰剂对照），每种处理有4个重复。因质量不佳，排除了1个样本（PEO4细胞系接受C处理的一个重复）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。