慢性常氧与缺氧下的人乳腺癌MCF-7和HCC1143细胞系TempO-Seq

该数据集来自omicsdi.org,收录了人乳腺癌MCF-7和HCC1143细胞系在慢性常氧与缺氧条件下的TempO-Seq转录组数据,用于比较luminal型与basal型乳腺癌细胞在两种氧环境中的基因表达差异

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基因组分类Transcriptomics
TempO-Seq of human breast cancer MCF-7 and HCC1143 cell lines under chronic normoxia and hypoxia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

慢性常氧与缺氧下的人乳腺癌MCF-7和HCC1143细胞系TempO-Seq

该数据集来自omicsdi.org,收录了人乳腺癌MCF-7和HCC1143细胞系在慢性常氧与缺氧条件下的TempO-Seq转录组数据,用于比较luminal型与basal型乳腺癌细胞在两种氧环境中的基因表达差异。细胞在96孔板中培养5天后,分别置于21%氧气(常氧)或1%氧气(缺氧)条件下处理,每个条件设3个生物学重复,样本经冷PBS洗涤、TempO-Seq裂解缓冲液裂解后于−80 °C保存并送至BioClavis进行全基因组TempO-Seq分析。该数据可用于研究乳腺癌细胞对慢性缺氧的转录响应及分型相关差异(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):比较慢性常氧与缺氧条件下luminal型和basal型乳腺癌细胞。细胞接种于96孔板,在常氧或缺氧条件下孵育5天,随后用冷PBS洗涤一次,并在室温下用TempO-Seq裂解缓冲液裂解15分钟。样本在运送至BioClavis进行全基因组TempO-Seq分析前保存于−80 °C。常氧(NX)使用21%氧气,缺氧(HX)使用1%氧气。每个条件有3个生物学重复。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12233

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数据说明

比较慢性常氧和缺氧条件下管腔型与基底型乳腺癌细胞。将细胞接种于96孔板中,在常氧或缺氧条件下孵育5天,随后用冷PBS洗涤孔一次,并使用TempO-Seq裂解缓冲液在室温下裂解15分钟。样品在运送至BioClavis进行全基因组TempO-Seq分析前,储存于−80 °C。常氧(NX)条件使用21%氧气,缺氧(HX)条件使用1%氧气。每种条件均有3个生物学重复。

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