T淋巴细胞诱导乳腺癌细胞表达冠蛋白-1A使其穿越血脑屏障模型迁移

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD053787

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：在既往工作中，我们发现T淋巴细胞在ER阴性乳腺癌脑转移增加中起突出作用。在本研究中，我们探讨了来源于对脑具有不同亲和力的癌症的乳腺癌细胞系中，因T细胞接触而发生的、与穿透血脑屏障（BBB）相关的表达变化。
方法：通过LC-MS比较乳腺癌细胞与T细胞共培养前后的蛋白质组，鉴定蛋白的差异表达。使用siRNA沉默肿瘤细胞中的蛋白表达，并采用人工BBB模型研究其对乳腺癌细胞系通过的影响。
结果：基于质谱的蛋白质组学显示，乳腺癌细胞系在接触T细胞后，有35种蛋白的表达发生显著改变。其中包括coronin-1A，这是一种与细胞运动相关的蛋白。敲低乳腺癌细胞中的CORO1A可将其穿过人工BBB的能力降低至60%。对于来源于对脑具有亲和力的乳腺癌的细胞系，这些影响显著较小。通过免疫组织化学和RT-PCR对52例转移性乳腺癌患者的乳腺癌样本进行了检测，这些患者有或无脑转移灶，从而证实了coronin-1A的表达。最后，在一个公开可用的mRNA表达数据库中验证了CORO1A上调，该数据库包含204例已知转移部位的原发性乳腺癌。
结论：我们得出结论，T淋巴细胞触发癌细胞表达包括coronin-1A在内的蛋白，从而促进其通过体外BBB。此外，coronin-1A在乳腺癌患者脑转移形成中的突出作用，因其在伴有脑转移的乳腺癌患者组织样本中上调而得到强烈提示。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。