MDA-MB-231 TGL细胞单细胞基因表达谱

该数据集为MDA-MB-231 TGL细胞的单细胞基因表达谱,来源于ebi.ac.uk,属于肿瘤/乳腺癌分类。数据主题标签包括单细胞编码RNA的RNA-seq和Homo sapiens

biostudies
浏览 8
基因组回归RNA-seq of coding RNA from single cellsHomo sapiens
Single Cell gene expression profile of MDA-MB-231 TGL cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

MDA-MB-231 TGL细胞单细胞基因表达谱

该数据集为MDA-MB-231 TGL细胞的单细胞基因表达谱,英文名称为 Single Cell gene expression profile of MDA-MB-231 TGL cells,来源于 ebi.ac.uk,在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向。其主题标签涵盖单细胞编码RNA的RNA-seq以及 Homo sapiens,说明数据围绕人源单细胞水平的编码RNA表达测量展开。源站描述指出,基线状态的 MDA-MB-231 TGL 细胞经过 scRNA-Seq 处理,形成该表达谱数据。整体而言,该数据集面向乳腺癌细胞系的单细胞转录组研究,可用于了解该细胞群体在基线条件下的基因表达特征,并为相关单细胞分析流程提供数据基础。

【数据集背景】

MDA-MB-231 是乳腺癌研究中常用的细胞系,TGL 细胞是该背景下的一种细胞形式。该数据集聚焦于基线状态下的 MDA-MB-231 TGL 细胞,采用单细胞 RNA 测序(scRNA-Seq)获取其基因表达信息。单细胞测序能够在单个细胞层面刻画转录组,相比群体水平测量,更便于观察细胞间的表达差异。该数据集归入肿瘤 / 乳腺癌分类,主题涉及单细胞编码RNA的RNA-seq与人源样本,适合在乳腺癌细胞模型的单细胞转录组研究中使用。

【数据内容】

数据内容为 MDA-MB-231 TGL 细胞的单细胞基因表达谱。源站描述表明,基线 MDA-MB-231 TGL 细胞经 scRNA-Seq 处理,因此数据核心是单细胞水平的基因表达测量结果。主题标签进一步指明其属于单细胞编码RNA的RNA-seq,物种为人(Homo sapiens)。关于细胞数量、测序深度、基因数量、表达矩阵格式等具体指标,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述仅说明基线 MDA-MB-231 TGL 细胞经过 scRNA-Seq 处理,未提供样本制备、测序平台、试剂版本、建库方法、测序读长等实验细节,这些内容源站未提供。数据所属分类为肿瘤 / 乳腺癌,主题标签包括 RNA-seq of coding RNA from single cells 与 Homo sapiens。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于乳腺癌相关细胞系的单细胞基因表达研究,例如考察 MDA-MB-231 TGL 细胞在基线条件下的转录组特征、开展单细胞层面的表达比较分析,以及作为单细胞 RNA 测序分析流程的输入数据。由于主题标签涉及单细胞编码RNA的RNA-seq和人源样本,也适合用于与单细胞转录组方法相关的分析场景。更具体的应用方向与验证结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以单细胞基因表达谱形式提供,使用时应按照单细胞 RNA 测序数据的常规分析思路进行读取与处理。关于文件格式、下载方式、数据组织结构和配套分析工具,源站未提供,需以源站实际提供的信息为准。

【质量与限制】

源站描述仅覆盖基线 MDA-MB-231 TGL 细胞经 scRNA-Seq 处理这一信息,未提供细胞质量控制指标、测序质量参数、批次信息、重复数量及数据完整性说明,这些内容源站未提供。该数据仅对应基线状态,是否可外推到其他处理条件或细胞状态,源站未提供依据。

【引用与许可】

该数据集来自 ebi.ac.uk,关于引用方式、许可条款和使用限制,源站未提供。使用时应遵循源站的相关规定。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-13896

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-MTAB-13896 MDA-MB-231 TGL细胞的单细胞基因表达谱 单细胞编码RNA的RNA-seq EFO EFO_0005684 智人 基线 MDA-MB-231 TGL细胞经scRNA-Seq处理。P-MTAB-141838 样本采集方案 EFO_0005518 单细胞悬液(scRNA seq)经

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案