表达抗p53短发夹RNA的MDA-MB-231细胞经TGFbeta或对照处理的shRNAi表达谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-14491

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TGFβ配体在早期肿瘤中充当肿瘤抑制因子，但在晚期癌症中却 paradoxically 转变为强效的促转移因子。这种转变的分子本质仍然神秘。我们现在表明，TGFβ依赖的细胞迁移、侵袭和转移由突变型p53增强。为了研究突变型p53和TGFβ控制乳腺癌细胞侵袭和转移的特定基因表达程序，我们比较了对照和突变型p53敲低的MDA-MB-231细胞的TGFβ转录组谱。实验总体设计：稳定表达对照（shGFP）或抗p53（shp53）短发夹RNA的MDA-MB-231细胞，未处理或用TGFbeta处理。然后处理样品进行总RNA提取并在Affymetrix微阵列上杂交。每种4个条件（1：未处理对照；2：TGFbeta处理的对照；3：未处理的p53敲低细胞；4：TGFbeta处理的突变型p53敲低细胞）使用四个生物学重复（A、B、C、D），共16个样品。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。