PRJNA319943：SFN或对照处理原位异种移植乳腺肿瘤的干细胞基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA319943

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中，我们探索了源自人乳腺癌细胞系(MDA-MB-231 D3H1 Luci)的乳腺肿瘤起始和生长的干细胞标志物谱。在本数据集中，我们纳入了经萝卜硫素预处理2周(每日腹腔注射50mg SFN/kg)并在细胞注射后继续治疗3周的原发性乳腺肿瘤的表达数据，并以0.9%生理盐水作为对照。总体设计：共分析了36个样本。我们构建了一个定制化的NanoString nCounter®基因表达代码集，包含107个基因和对照，其中涵盖重要的胚胎核心干细胞基因及上皮-间质转化(EMT)-间质-上皮转化(MET)标志物。我们使用nSolver 2.070版本进行了以下配对比较：SFN vs. 生理盐水。筛选标准为p值< 0.05且绝对倍数变化为1.5的基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。