PRJNA319942：SFN或对照处理的原位异种移植乳腺肿瘤干细胞基因表达谱II
本数据集来自NCBI，聚焦人乳腺癌细胞系MDA-MB-231 D3H1 Luci来源的原位异种移植乳腺肿瘤，比较Sulforaphane（SFN）处理与生理盐水对照的干细胞标志物表达谱
基本信息
资源简介
PRJNA319942：SFN或对照处理的原位异种移植乳腺肿瘤干细胞基因表达谱II
本数据集来自NCBI，聚焦人乳腺癌细胞系MDA-MB-231 D3H1 Luci来源的原位异种移植乳腺肿瘤，比较Sulforaphane（SFN）处理与生理盐水对照的干细胞标志物表达谱。共分析36个样本，使用NanoString nCounter Human Stem Cell进行表达检测，并通过nSolver生成SFN vs. Saline的成对比较，筛选p值<0.05且绝对倍数变化为1.5的基因。数据可用于研究SFN对乳腺肿瘤干细胞相关基因表达的影响（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：在本研究中，我们探索了源自人乳腺癌细胞系（MDA-MB-231 D3H1 Luci）的乳腺肿瘤起始和生长的干细胞标志物谱。在本数据集中，我们纳入了经Sulforaphane预处理2周（每日腹腔注射50mg SFN/kg）并在细胞注射后继续治疗3周的原发性乳腺肿瘤的表达数据，以及0.9%生理盐水作为对照。总体设计：共分析36个样本。我们使用了市售的NanoString nCounter Human Stem Cell。我们使用nSolver版本2.070生成了以下成对比较：SFN vs. Saline。选择p值<0.05且绝对倍数变化为1.5的基因。
【主题与分类】
主题标签：Other。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA319942
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA319942
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中，我们探索了源自人乳腺癌细胞系（MDA-MB-231 D3H1 Luci）的乳腺肿瘤起始和生长的干细胞标志物谱。在本数据集中，我们纳入了经萝卜硫素预处理2周（每日腹腔注射50mg SFN/kg）并在细胞注射后继续治疗3周的原发性乳腺肿瘤的表达数据，并以0.9%生理盐水作为对照。总体设计：共分析了36个样本。我们使用了市售的NanoString nCounter Human Stem Cell。我们使用nSolver 2.070版本生成了以下配对比较：SFN vs. 生理盐水。选取p值< 0.05且绝对倍数变化为1.5的基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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