ESR1 Y537S突变特异性增强子及其下游靶点IGFBP3的鉴定与验证 [ChIP-Seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1470756），主题为鉴定与验证 ESR1 Y537S 突变特异性增强子及其下游靶点 IGFBP3，采用 ChIP-Seq 技术，属于表观基因组学范畴，本站归类为肿瘤/乳腺癌
![PRJNA1470756: Identification and validation of an ESR1 Y537S mutant-specific enhancer and its downstream target IGFBP3 [ChIP-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/70791.jpg)
基本信息
资源简介
ESR1 Y537S突变特异性增强子及其下游靶点IGFBP3的鉴定与验证 [ChIP-Seq]
PRJNA1470756 是 NCBI BioProject 数据库中的一项记录，标题为“Identification and validation of an ESR1 Y537S mutant-specific enhancer and its downstream target IGFBP3 [ChIP-Seq]”。该数据集围绕 ESR1 Y537S 突变特异性增强子的鉴定与验证展开，并关注其下游靶点 IGFBP3，采用 ChIP-Seq 技术产生数据，主题标签为表观基因组学（Epigenomics）。在本地分类中，该数据集归属于肿瘤／乳腺癌方向。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将同一项研究计划下产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集即通过这一框架对外发布，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究计划聚焦于 ESR1 Y537S 突变。ESR1 基因的 Y537S 突变是乳腺癌相关研究中的关注点之一，而本研究的目标是鉴定并验证与该突变相关的特异性增强子，以及该增强子下游的靶点 IGFBP3。研究采用 ChIP-Seq 技术，属于表观基因组学范畴。在本地分类体系中，该数据集被归入肿瘤／乳腺癌类别。源站标题中明确标注了“[ChIP-Seq]”，表明该 BioProject 记录所涵盖的数据类型以 ChIP-Seq 为主。关于该研究计划的具体发起机构、所属组织或联盟，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的主题为鉴定与验证 ESR1 Y537S 突变特异性增强子及其下游靶点 IGFBP3，采用 ChIP-Seq 技术。主题标签为 Epigenomics，表明其数据内容属于表观基因组学范畴。BioProject 记录本身是一个集合性入口，用于汇集同一研究计划下产生的多种数据类型，并提供指向这些数据的链接。关于该数据集具体包含的样本数量、测序深度、文件格式、基因组版本、抗体信息或重复次数等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录标识为 BioProject ID 1470756。BioProject 是生物数据的集合，源自单一组织或联盟所发起的单一研究计划；BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，以查找该项目所产生的多种数据类型。关于样本采集的具体方式、实验处理流程、测序平台、建库方法以及数据处理管线等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与分类，该数据集适用于表观基因组学相关的研究场景，尤其是围绕 ESR1 Y537S 突变特异性增强子鉴定与验证，以及下游靶点 IGFBP3 的研究。在肿瘤／乳腺癌方向，该数据集可用于探索突变特异性调控元件及其靶基因的相关分析。由于采用 ChIP-Seq 技术，其数据形式适合用于染色质免疫共沉淀测序相关的分析流程。关于更具体的适用场景、推荐分析工具或下游应用方向，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式发布，用户可通过 BioProject ID 1470756 在 NCBI 站点定位该记录，并借助 BioProject 提供的链接入口查找该项目下产生的多种数据类型。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤、分析参数或配套代码等具体使用指引，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开的生物数据集合记录。关于数据质量评估指标、数据完整性、批次效应、技术偏差、验证实验结果或样本量是否充分等信息，源站未提供。使用者在将该数据集用于分析时，应结合源站记录自行核实相关细节。该数据集的主题标签为 Epigenomics，本地分类为肿瘤／乳腺癌，这些分类信息可作为筛选与检索的参考，但不构成对数据质量的评价。
【引用与许可】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录，ID 为 1470756。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求等信息，源站未提供。使用者如需引用或使用该数据集，应查阅源站记录以获取准确的引用与许可说明。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1470756
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
抑制雌激素受体（ER）介导信号传导的内分泌治疗是ER阳性乳腺癌的基石疗法，而ER阳性乳腺癌占所有乳腺癌病例的75%以上。然而，相当一部分患者会出现内分泌治疗耐药，其中编码ER-alpha的ESR1基因热点错义点突变是导致此类耐药的主要机制之一。尽管近期研究为突变ER的作用和活性提供了新的见解，但能够克服这种突变ER介导的内分泌耐药的有效疗法仍难以实现。利用源自转移性乳腺癌患者的携带ESR1 Y537S突变的循环肿瘤细胞系，以及携带相同突变的基因工程乳腺癌细胞系，我们的分析鉴定出一个被Y537S突变ER特异性结合的新型增强子区域。删除该增强子区域可导致体外细胞增殖和黏附减少、体内致瘤性降低，并增强Y537S ER突变细胞对氟维司群的敏感性。
我们随后确定IGFBP3是该增强子的下游靶标，并验证了其在某些Y537S ER相关表型中的作用。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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