PRJNA1470239:瞬时CB2R调控促进管腔样分化并限制乳腺癌可塑性
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1470239),主题为瞬时 CB2R 调控促进管腔样分化并限制乳腺癌可塑性,属于肿瘤/乳腺癌方向,主题标签为 Epigenomics

基本信息
资源简介
PRJNA1470239:瞬时CB2R调控促进管腔样分化并限制乳腺癌可塑性
该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项乳腺癌相关研究项目,编号为 PRJNA1470239,英文标题为“Transient CB2R Modulation Promotes Luminal-like Differentiation and Restricts Breast Cancer Plasticity”。从标题可以看出,该研究关注瞬时 CB2R 调控对乳腺癌细胞管腔样分化的促进作用,以及对肿瘤可塑性的限制效应。数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为 Epigenomics,提示其数据内容与表观基因组学相关。该项目的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录,用户可通过该记录获取与该项目相关的多种数据类型链接。整体而言,该数据集围绕乳腺癌细胞分化与可塑性调控这一研究主题,提供了可供进一步分析的表观基因组学相关数据资源。
【数据集背景】
该数据集对应的研究项目聚焦于乳腺癌中 CB2R 的瞬时调控作用。标题明确指出,瞬时 CB2R 调控能够促进管腔样分化,并限制乳腺癌的可塑性。这一主题涉及肿瘤细胞命运决定、分化状态维持以及可塑性调控等基础肿瘤生物学问题。数据集被归类为肿瘤 / 乳腺癌方向,说明其研究背景与乳腺癌的发生、发展或治疗相关。主题标签为 Epigenomics,表明该项目产生的数据可能涉及表观遗传层面的变化,例如染色质状态、组蛋白修饰或 DNA 甲基化等表观基因组学特征。该数据集来源于 NCBI BioProject,属于一个由单一机构或联盟发起的生物学数据集合,旨在为用户提供与该项目相关的多种数据类型链接。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Epigenomics,说明其数据内容属于表观基因组学范畴。源站描述指出,BioProject 记录本身是一个集合,用于汇集与单一研究计划相关的多种生物数据,并提供链接以访问该项目生成的不同数据类型。因此,该数据集可能包含与瞬时 CB2R 调控相关的表观基因组学数据,例如测序数据、注释信息或其他高通量数据产物。然而,关于具体的数据类型、样本数量、测序平台、数据格式或文件大小等细节,源站未提供。该数据集的核心主题为瞬时 CB2R 调控促进管腔样分化并限制乳腺癌可塑性,其数据内容应围绕这一生物学问题展开,但具体的数据组成需通过源站链接进一步获取。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体收录于 NCBI BioProject 数据库,项目编号为 PRJNA1470239。源站标题为“Transient CB2R Modulation Promotes Luminal-like Di... (ID 1470239) - BioProject - NCBI”。根据源站描述,BioProject 是一个生物学数据集合,与单一研究计划相关,该计划源自单一机构或联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,以便找到该项目生成的不同数据类型链接。关于该数据集的具体采集方法、实验设计、样本来源、伦理审批信息或数据生成平台等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 乳腺癌方向的研究,尤其是关注 CB2R 调控、管腔样分化以及乳腺癌可塑性限制的课题。由于主题标签为 Epigenomics,该数据集可用于表观基因组学相关分析,例如探索瞬时 CB2R 调控引起的表观遗传变化。此外,该数据集也可作为 BioProject 记录,用于检索和链接与该项目相关的多种数据类型,支持二次分析或整合研究。具体适用场景需结合源站提供的实际数据内容确定,源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该数据集,项目编号为 PRJNA1470239。BioProject 记录提供与该项目相关的不同数据类型链接,用户可据此获取相应的数据文件或进一步跳转至相关数据库。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具或参数设置,源站未提供。建议用户依据 BioProject 记录中的链接和说明进行操作,并结合自身研究需求选择合适的数据类型。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库收录的项目记录。源站描述仅说明 BioProject 是相关生物数据的集合,并提供链接,未提供关于数据质量、完整性、准确性或技术验证的具体信息。该数据集的主题标签为 Epigenomics,但具体数据质量指标、覆盖度、重复性等信息源站未提供。此外,该数据集可能受限于原始研究的设计和样本范围,用户在使用时需注意其适用范围。关于数据限制的更多细节,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 PRJNA1470239。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息,源站未提供。用户在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 数据库的通用引用规范以及源站记录中可能提供的引用信息。具体许可条件需以源站说明为准,源站未提供详细内容。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1470239
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
癌细胞可塑性通过允许干样状态与分化状态之间的转换,使肿瘤产生治疗耐药和转移。基于分化的策略旨在稳定肿瘤细胞身份,但能够诱导持久谱系限制的药理学方法仍然有限。在此,我们表明,短暂调节大麻素受体2(CB2R)可在乳腺癌模型中促进持久的管腔样稳定化。利用患者来源和小鼠肿瘤类器官,我们证明,短暂、低剂量CB2R调节可降低自我更新、侵袭性和肿瘤起始能力,同时增强他莫昔芬敏感性并限制耐药表型的出现。这些效应在促去分化条件下持续存在,包括TGFb暴露、基质共培养、免疫信号和机械应激,并且在原位移植后在体内长期维持。RNAseq分析揭示了从早期可塑性状态向稳定的管腔样身份的转变轨迹,CUT&Tag分析通过揭示这一转变中的染色质重塑为该过程提供了支持。
总之,我们的研究结果将CB2R重新定义为肿瘤细胞状态的调节因子,而不仅仅是细胞毒性反应的介导者,并确立了瞬时CB2R调节作为一种通过分化导向疗法持久限制乳腺癌可塑性的策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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