基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1449208：早期乳腺癌患者外显子组测序研究 FOXA1 突变

该数据集为 NCBI BioProject 收录的人类外显子组测序项目，编号 1449208，英文名称为“Exome sequencing of early breast cancer patients to study FOXA1 mutations”。从名称可以看出，该项目聚焦于早期乳腺癌患者，通过外显子组测序手段研究 FOXA1 基因突变。数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向，主题标签为 Exome，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集生物数据的记录形式，通常来自单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。因此，该数据集可视为一个以早期乳腺癌 FOXA1 突变研究为核心的外显子组测序项目入口，便于研究者定位和访问相关测序数据。

【数据集背景】

该数据集对应的 BioProject 记录标题为“Homo sapiens (ID 1449208) - BioProject - NCBI”，表明其研究对象为人源样本，项目编号为 1449208。项目全称为“Exome sequencing of early breast cancer patients to study FOXA1 mutations”，说明其研究背景是早期乳腺癌，研究切入点为 FOXA1 基因突变。BioProject 作为生物数据集合，来源于单一组织或联合体，旨在将同一研究计划下产生的多样数据类型集中呈现，使用户能够通过一个记录入口找到相关数据链接。该数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为 Exome，进一步指向外显子组测序这一技术层面。

【数据内容】

该数据集的核心内容为早期乳腺癌患者的外显子组测序数据，用于研究 FOXA1 突变。主题标签为 Exome，说明数据与外显子组测序相关。源站描述指出，BioProject 记录提供用户单一位置以查找该项目生成的不同数据类型链接，因此该数据集可能作为项目入口，关联外显子组测序产生的数据资源。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、覆盖深度、突变位点、数据文件格式与体积等具体内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的记录，项目编号 1449208。源站描述说明，BioProject 可来自单一组织或联合体，是围绕单一研究计划汇集的生物数据集合。该项目的具体样本采集地点、采集时间、机构名称、伦理审批信息以及测序实验流程等，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与早期乳腺癌 FOXA1 突变相关的外显子组测序研究场景，可供研究者查找该 BioProject 所关联的数据类型与链接。其分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为 Exome，因此也可作为乳腺癌外显子组测序数据检索与整合的入口。关于该数据集是否适用于其他癌种、其他基因或非外显子组分析，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 NCBI BioProject 记录，用户可通过来源站 ncbi.nlm.nih.gov 访问项目编号 1449208 对应的页面，并借助 BioProject 记录查找该项目生成的不同数据类型链接。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具与参数设置，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开数据库记录。源站描述仅说明 BioProject 是围绕单一研究计划汇集的生物数据集合，并提供查找多种数据类型的统一入口。关于数据质量评估、测序质量指标、样本纳入排除标准、数据完整性以及使用限制等，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1449208。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用协议以及是否允许再分发等，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1449208

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1449208

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含早期乳腺癌患者的外显子组测序数据。旨在探究FOXA1体细胞突变与临床结局之间的关联。这些数据可能有助于理解FOXA1改变在乳腺癌中的分子机制及预后意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别