PRJNA1442800:Interleukin-34 诱导的 Arg1+ 巨噬细胞在乳腺癌脑转移中的关键作用
该数据集来自 NCBI BioProject,编号 PRJNA1442800,主题为 Interleukin-34 诱导的 Arg1+ 巨噬细胞在乳腺癌脑转移中发挥关键作用

基本信息
资源简介
PRJNA1442800:Interleukin-34 诱导的 Arg1+ 巨噬细胞在乳腺癌脑转移中的关键作用
PRJNA1442800 是一个来自 NCBI BioProject 数据库的生物学研究项目记录,其完整英文名称为“Interleukin-34 induced Arg1+ macrophages play a key role in breast cancer brain metastasis”。从标题可以看出,该项目聚焦于白细胞介素-34(Interleukin-34)诱导的 Arg1 阳性巨噬细胞在乳腺癌脑转移过程中所发挥的关键作用。该数据集在分类上归属于肿瘤领域下的乳腺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为 NCBI 提供的一种资源组织方式,旨在将围绕同一研究计划、来自同一机构或联合体产生的多种类型生物学数据汇集在一起,使用户能够通过单一入口找到与该项目相关的各类数据链接。因此,PRJNA1442800 为研究者提供了一个集中获取该乳腺癌脑转移研究相关数据资源的入口。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究项目关注乳腺癌脑转移这一复杂的病理过程。乳腺癌是常见的恶性肿瘤之一,而脑转移是乳腺癌患者预后较差的重要事件。该项目标题明确指出 Interleukin-34 诱导的 Arg1+ 巨噬细胞在其中扮演关键角色,说明研究重点在于探索特定细胞因子与免疫细胞亚群在脑转移微环境中的作用机制。BioProject 作为 NCBI 的核心资源之一,用于收录与单一研究计划相关的生物学数据,其记录本身并不直接包含实验数据,而是提供指向该项目所产生的多种数据类型链接的集中入口。该项目的主题标签为“Other”,表明其在 NCBI 的主题分类中未被归入更具体的预设类别。
【数据内容】
源站未提供该 BioProject 所包含的具体数据内容细节,例如样本数量、测序类型、基因组或转录组数据文件等。BioProject 记录的设计目的是为用户提供一个单一位置,以便发现和访问该项目生成的不同类型数据。因此,该数据集的具体数据内容需通过其记录中的链接进一步查看。本站分类将其归入肿瘤 / 乳腺癌,主题标签为“Other”,这些信息可用于初步判断其所属的研究领域。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心(NCBI)。BioProject 记录通常来源于单一组织或联合体提交的研究计划。关于该项目的具体提交机构、样本采集地点、采集时间、实验方法等细节,源站未提供。该记录在 NCBI BioProject 数据库中的编号为 PRJNA1442800,用户可通过该编号在 NCBI 网站上检索到对应页面。
【适用场景】
该数据集适用于与乳腺癌脑转移、肿瘤免疫微环境、巨噬细胞极化、Interleukin-34 信号通路等方向相关的研究人员。通过访问该 BioProject 记录,用户可以定位到该项目产生的各类生物学数据,用于二次分析、 meta 分析或方法学参考。此外,对 BioProject 数据库结构感兴趣的用户,也可以将其作为了解 NCBI 数据组织方式的示例。由于该记录主题标签为“Other”,在 NCBI 内部的主题检索中可能不会出现在常规的肿瘤分类下,因此通过编号或标题关键词检索更为可靠。
【使用方法】
用户可访问 NCBI BioProject 数据库,使用编号 PRJNA1442800 或标题关键词进行检索,进入该项目的记录页面。在记录页面中,用户可以找到指向该项目所生成的不同数据类型(如 SRA、GenBank 等)的链接。具体的数据下载和分析流程取决于用户所需的数据类型,源站未提供针对该项目的特定使用说明。建议用户根据自身研究目的,结合 NCBI 提供的通用数据访问工具进行操作。
【质量与限制】
BioProject 记录本身是元数据记录,其质量取决于提交者提供的信息。源站未提供该项目的具体质量控制指标、数据完整性评估或使用限制说明。用户在使用该项目相关数据时,应参考 NCBI 各子数据库的通用质量标准和限制条款。此外,由于该记录主题标签为“Other”,在分类检索时可能存在一定不便。源站未提供该数据集的许可信息、使用限制或伦理审查相关内容。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款。用户在使用该项目数据时,应遵循 NCBI 网站的整体使用政策,并在发表成果时按照学术规范引用对应的 BioProject 记录及原始数据来源。建议用户直接访问 NCBI 页面获取最新的引用和许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1442800
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们使用10x Genomics对两块肿瘤组织进行Visium RNA测序,结果显示每个细胞簇中的细胞类型聚类和全基因组图谱。使用Visium CytAssist空间基因表达试剂盒对FFPE样本进行处理(小鼠转录组,6.5 mm,4次反应,PN-1000521,10x Genomics)。
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