EZH2催化与非经典功能协同调控使肿瘤对CAR-T细胞疗法敏感

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1432532

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了EZH2（催化性和非经典）在调节肿瘤细胞黏附及对CAR-T细胞疗法敏感性中的双重作用。我们对三种人三阴性乳腺癌细胞系（MDA-MB-436、MDA-MB-468、HCC1806）进行了RNA-seq和CUT&Tag-seq（抗EZH2），这些细胞系均接受了EZH2抑制剂EPZ-6438处理。此外，我们还对EZH2敲低的MDA-MB-468细胞进行了RNA-seq，以解析EZH2依赖的转录组学基础，涉及肿瘤细胞黏附和CAR-T疗法响应。总体设计：为探究EZH2在乳腺癌细胞（MDA-MB-436、MDA-MB-468、HCC1806）中的调控作用，我们实施了以下分组的RNA-seq和CUT&Tag-seq（针对EZH2）实验：EPZ-6438处理组：三种乳腺癌细胞系（MDA-MB-436、MDA-MB-468、HCC1806）经EZH2抑制剂EPZ-6438处理后，每种细胞系在RNA-seq和CUT&Tag-seq中均设有3个生物学重复。EZH2敲低组：MDA-MB-468细胞转染了针对EZH2的shRNA（shEZH2），RNA-seq设有3个生物学重复。

对照组：DMSO对照组：相应细胞系（MDA-MB-436、MDA-MB-468、HCC1806）经DMSO（溶剂对照）处理，用于RNA-seq和CUT&Tag-seq的3个生物学重复。非靶向shRNA对照组（shNC）：转染非靶向shRNA的MDA-MB-468细胞，用于RNA-seq的3个生物学重复。所有样本均在Illumina HiSeq平台上以2×150 bp双端读长进行测序。提供了原始测序数据（fastq格式）以供进一步分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。