miR-99b-5p抑制驱动三阴性乳腺癌凋亡与肿瘤缩小：基于AGO2-RIP-seq的功能表征及机制研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1429275

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

背景：微小RNA（miRNA）失调是乳腺癌生物学的重要驱动因素，但许多miRNA的功能作用仍未完全阐明。miR-99b-5p在多种癌症类型中被广泛表征为一种抑癌miRNA，其表达在肿瘤中相较于正常组织持续降低。与之相反，我们对乳腺癌数据集的分析揭示了一种独特的表达模式：miR-99b-5p在乳腺肿瘤中显著上调，提示其具有情境依赖的致癌功能。在本研究中，我们将miR-99b-5p鉴定为三阴性乳腺癌（TNBC）中的致癌驱动因子。方法与结果：基于TCGA的表达谱分析证实了其在乳腺肿瘤中的水平升高。功能实验表明，在TNBC细胞中下调miR-99b-5p可抑制增殖并诱导凋亡，表明其在维持肿瘤细胞存活中发挥关键作用。为阐明该活性背后的分子机制，我们进行了AGO2-RNA免疫沉淀联合高通量测序（AGO2-RIP-Seq），从而能够无偏倚地鉴定与miR-99b-5p相关的转录本。

通路富集分析显示，其直接靶点集中于凋亡调控、细胞周期控制及泛素介导的蛋白质降解。通过qRT-PCR、Western印迹和荧光素酶试验进行的机制验证证实，miR-99b-5p通过DR5和BAK调控TRAIL-R信号通路，从而减弱凋亡信号传导。使用稳定表达miR-99b-5p敲低的MDA-MB-231细胞建立的异种移植模型进行的体内研究显示，肿瘤明显消退，进一步支持了其致癌作用。结论：总体而言，这些发现确立了miR-99b-5p作为乳腺癌中一种情境特异性的致癌miRNA，并作为一个有前景的治疗靶点，尤其对于治疗选择仍然有限的三阴性乳腺癌（TNBC）而言。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。