PRJNA1426978：NCOR2 抑制 MHC I 类分子表达驱动乳腺癌转移

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1426978

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转移进展取决于播散性肿瘤细胞逃避免疫监视的能力。MHC介导的抗原呈递促进T细胞依赖性清除转移性肿瘤细胞。我们鉴定出核受体辅阻遏物2（NCOR2）是乳腺肿瘤细胞MHC I类分子呈递的表观遗传调控因子。表达高水平NCOR2的三阴性乳腺癌（TNBC）患者也表现出无转移生存期缩短和MHC I类表达降低，且TNBC患者的转移病灶具有高核NCOR2和减少的CD8+ T细胞。降低NCOR2表达或阻止其与HDAC3相互作用，可增强先天免疫细胞的募集和活性，并提高播散性癌细胞上的MHC I类水平，从而增强CD8+ T细胞活性和诱导凋亡，阻止转移进展。这些研究提供了证据支持NCOR2作为转移的可靶向表观遗传调控因子，可据此开发疗法以降低患者死亡率。总体设计：使用CUT&Tag对4T07细胞中的NCOR2结合位点进行了分析。以EGFP敲低4T07细胞系作为阴性对照。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。