PRJNA1416261:靶向肿瘤-视网膜抗原PDE6G的mRNA-LNP疫苗激发抗乳腺癌强效抗肿瘤免疫
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题为转录组或基因表达。研究围绕乳腺癌mRNA疫苗开发展开,识别出在乳腺肿瘤中异常过表达的免疫豁免视网膜富集抗原PDE6G,并构建PDE6G mRNA-LNP疫苗

基本信息
资源简介
PRJNA1416261:靶向肿瘤-视网膜抗原PDE6G的mRNA-LNP疫苗激发抗乳腺癌强效抗肿瘤免疫
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题为转录组或基因表达。研究围绕乳腺癌mRNA疫苗开发展开,识别出在乳腺肿瘤中异常过表达的免疫豁免视网膜富集抗原PDE6G,并构建PDE6G mRNA-LNP疫苗。数据涵盖疫苗接种后CD8+ T细胞应答、效应T细胞与IFN功能性T细胞亚群克隆扩增、肿瘤生长抑制及scRNA-seq揭示的肿瘤免疫微环境重塑等内容,可用于肿瘤免疫、疫苗机制与单细胞转录组相关研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):有效的乳腺癌mRNA疫苗开发一直受限于缺乏高免疫原性和肿瘤特异性抗原。在此,我们鉴定出PDE6G,一种在乳腺肿瘤中异常过表达的免疫豁免视网膜富集抗原,并开发了PDE6G mRNA-LNP疫苗。接种疫苗引发了强效的CD8+ T细胞应答,促进了效应T细胞和具有IFN能力的T细胞亚群的克隆扩增,并抑制了肿瘤生长,且未检测到毒性。单细胞RNA测序(scRNA-seq)显示,PDE6G mRNA-LNP疫苗接种通过扩增抗原呈递的Cd74+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),同时减少免疫抑制性Maf+巨噬细胞,并增强巨噬细胞与CD8+ T细胞之间的串扰,从而重塑肿瘤免疫微环境(TIME)。此外,将PDE6G mRNA-LNP与PD-1阻断联合使用进一步提高了抗肿瘤疗效。这些发现
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1416261
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1416261
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- OpenDataLab:
数据说明
针对乳腺癌的有效mRNA疫苗开发一直受限于缺乏高免疫原性和肿瘤特异性抗原。在此,我们鉴定出PDE6G——一种免疫豁免的视网膜富集抗原,在乳腺肿瘤中异常过表达——并开发了PDE6G mRNA-LNP疫苗。接种疫苗可引发强效的CD8+ T细胞应答,促进效应性和具有IFN应答能力的T细胞亚群的克隆扩增,并抑制肿瘤生长,且未检测到毒性。单细胞RNA测序(scRNA-seq)显示,PDE6G mRNA-LNP疫苗接种通过扩增抗原呈递性Cd74+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),同时减少免疫抑制性Maf+巨噬细胞,并增强巨噬细胞与CD8+ T细胞之间的串扰,从而重塑肿瘤免疫微环境(TIME)。此外,将PDE6G mRNA-LNP与PD-1阻断联合使用进一步提高了抗肿瘤疗效。这些发现确立了癌-视网膜抗原作为有前景的疫苗靶点,并证明PDE6G mRNA-LNP可协调适应性免疫与肿瘤微环境重塑,为乳腺癌免疫治疗提供了一种安全且强效的策略。
总体设计:表达PDE6G的肿瘤模型(实验组)接受了PDE6G mRNA-LNP疫苗的免疫接种。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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