PRJNA1416261:靶向肿瘤-视网膜抗原PDE6G的mRNA-LNP疫苗激发抗乳腺癌强效抗肿瘤免疫

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题为转录组或基因表达。研究围绕乳腺癌mRNA疫苗开发展开,识别出在乳腺肿瘤中异常过表达的免疫豁免视网膜富集抗原PDE6G,并构建PDE6G mRNA-LNP疫苗

sra
浏览 8
基因组分类Transcriptome or Gene expression疫苗编码
PRJNA1416261: Targeting the Cancer-Retina Antigen PDE6G with mRNA-LNP Vaccine Elicits Potent Anti-Tumor Immunity Against Breast Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

PRJNA1416261:靶向肿瘤-视网膜抗原PDE6G的mRNA-LNP疫苗激发抗乳腺癌强效抗肿瘤免疫

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题为转录组或基因表达。研究围绕乳腺癌mRNA疫苗开发展开,识别出在乳腺肿瘤中异常过表达的免疫豁免视网膜富集抗原PDE6G,并构建PDE6G mRNA-LNP疫苗。数据涵盖疫苗接种后CD8+ T细胞应答、效应T细胞与IFN功能性T细胞亚群克隆扩增、肿瘤生长抑制及scRNA-seq揭示的肿瘤免疫微环境重塑等内容,可用于肿瘤免疫、疫苗机制与单细胞转录组相关研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):有效的乳腺癌mRNA疫苗开发一直受限于缺乏高免疫原性和肿瘤特异性抗原。在此,我们鉴定出PDE6G,一种在乳腺肿瘤中异常过表达的免疫豁免视网膜富集抗原,并开发了PDE6G mRNA-LNP疫苗。接种疫苗引发了强效的CD8+ T细胞应答,促进了效应T细胞和具有IFN能力的T细胞亚群的克隆扩增,并抑制了肿瘤生长,且未检测到毒性。单细胞RNA测序(scRNA-seq)显示,PDE6G mRNA-LNP疫苗接种通过扩增抗原呈递的Cd74+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),同时减少免疫抑制性Maf+巨噬细胞,并增强巨噬细胞与CD8+ T细胞之间的串扰,从而重塑肿瘤免疫微环境(TIME)。此外,将PDE6G mRNA-LNP与PD-1阻断联合使用进一步提高了抗肿瘤疗效。这些发现

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1416261

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1416261

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

针对乳腺癌的有效mRNA疫苗开发一直受限于缺乏高免疫原性和肿瘤特异性抗原。在此,我们鉴定出PDE6G——一种免疫豁免的视网膜富集抗原,在乳腺肿瘤中异常过表达——并开发了PDE6G mRNA-LNP疫苗。接种疫苗可引发强效的CD8+ T细胞应答,促进效应性和具有IFN应答能力的T细胞亚群的克隆扩增,并抑制肿瘤生长,且未检测到毒性。单细胞RNA测序(scRNA-seq)显示,PDE6G mRNA-LNP疫苗接种通过扩增抗原呈递性Cd74+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),同时减少免疫抑制性Maf+巨噬细胞,并增强巨噬细胞与CD8+ T细胞之间的串扰,从而重塑肿瘤免疫微环境(TIME)。此外,将PDE6G mRNA-LNP与PD-1阻断联合使用进一步提高了抗肿瘤疗效。这些发现确立了癌-视网膜抗原作为有前景的疫苗靶点,并证明PDE6G mRNA-LNP可协调适应性免疫与肿瘤微环境重塑,为乳腺癌免疫治疗提供了一种安全且强效的策略。

总体设计:表达PDE6G的肿瘤模型(实验组)接受了PDE6G mRNA-LNP疫苗的免疫接种。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案