基本信息

模态

时间序列

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

Runx1与Runx2协同抑制Wnt/β-catenin驱动的乳腺肿瘤发生并影响乳腺干性和免疫微环境

PRJEB88701 是 NCBI BioProject 收录的一个生物项目，其研究主题为 Runx1 与 Runx2 协同抑制 Wnt/b-catenin 驱动的乳腺肿瘤发生，并影响乳腺干性与免疫微环境。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向，来源于 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为生物数据的集合，通常围绕某一项单一研究计划而建立，由单一机构或联盟发起，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。PRJEB88701 正是这样一个围绕特定乳腺肿瘤发生机制研究而组织的项目记录，其核心关注点在于 Runx1、Runx2 两个因子如何共同作用，抑制由 Wnt/b-catenin 信号通路驱动的肿瘤发生过程，同时涉及乳腺干性以及免疫微环境方面的研究内容。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 中的 PRJEB88701 项目。从源站标题来看，其完整表述为“Runx1 and Runx2 act in concert to suppress Wnt/b-catenin-driven mammary tumourigenesis impacting on mammary stemness and the immune microenvironment”。这一标题直接点明了研究的生物学问题：Runx1 与 Runx2 是否以及如何协同抑制 Wnt/b-catenin 所驱动的乳腺肿瘤发生，并且这种抑制作用与乳腺干性及免疫微环境之间存在关联。该项目的主题标签为“Other”，本站分类归入肿瘤 / 乳腺癌，说明其研究背景落在乳腺癌及相关肿瘤发生机制领域。BioProject 本身是生物数据的集合，来源于单一研究计划或联盟，旨在为用户提供查找不同数据类型链接的统一入口，因此 PRJEB88701 也承载着组织并关联该项目相关数据的作用。

【数据内容】

源站未提供该项目具体包含哪些数据类型的详细说明，例如是否包含测序数据、表达数据、样本信息或分析结果等均未在已有信息中列出。已知的信息仅包括项目名称、研究主题、主题标签以及分类归属。因此，无法进一步描述该数据集内部的具体数据构成、文件格式、样本数量或变量字段。可以确定的是，作为 BioProject 记录，其设计目的是将围绕同一研究计划产生的多种数据类型集中呈现，并提供相应链接入口，但具体数据内容需以源站实际记录为准。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录。BioProject 的定位是收集与单一研究计划相关的生物数据，这些计划通常来自单一组织或联盟。PRJEB88701 作为其中一条记录，其来源站为 NCBI，项目英文名称已明确给出。关于样本采集方式、实验设计、受试对象、时间范围、地理来源等具体采集信息，源站未提供，因此无法在此展开。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与乳腺癌肿瘤发生机制相关的研究场景，尤其是关注 Runx1、Runx2 协同作用、Wnt/b-catenin 信号通路、乳腺干性以及免疫微环境的研究方向。由于本站分类为肿瘤 / 乳腺癌，它可能对肿瘤生物学、乳腺发育与干性研究、免疫微环境分析等领域的科研人员具有参考价值。此外，作为 BioProject 记录，它也可用于查找与该研究计划相关的多种数据类型链接。但具体适用场景仍需结合源站提供的实际数据内容判断，源站未提供更细化的使用建议。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法，包括如何下载、如何访问各数据类型链接、是否需要注册或遵循特定协议等均未说明。通常 BioProject 记录会提供指向不同数据类型的链接入口，但针对 PRJEB88701 的具体操作方式，现有信息不足以给出步骤性说明。因此，使用方法部分只能标注为源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、准确性、覆盖度或技术验证等方面的信息。已知的限制在于，当前可获取的描述仅涵盖项目名称、研究主题、分类和来源站，缺乏对数据规模、样本量、实验方法、统计指标及结论的详细说明。因此，无法对该数据集的质量进行评价，也无法列出具体限制条件。使用时应以 NCBI BioProject 源站记录为准，并注意核对项目最新信息。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款。由于缺乏相关说明，无法确认其是否允许自由使用、再分发或商业用途。建议在引用或使用前直接访问 NCBI BioProject 中 PRJEB88701 的记录页面，以获取官方提供的引用要求和许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB88701

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB88701

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转录因子RUNX1及其结合伙伴CBFb的基因已被报道在人类乳腺癌中发生突变。我们首次展示，在基因工程小鼠模型中Runx1的缺失会导致疾病发作加速和肿瘤发展，从而将RUNX1定位为乳腺癌中的抑癌基因。Runx1与相关家族成员Runx2的共同缺失导致乳腺上皮细胞对WNT驱动的转化变得极为敏感，并在生命早期出现多个肿瘤。克隆形成实验表明，Runx1的消融诱导了乳腺上皮细胞中的干细胞样表型，而转录组分析则显示多个致癌通路的激活，尤其是在Runx2共同缺失时。虽然Runx2本身的缺失并未促进肿瘤形成，但我们观察到当Runx2和Runx1同时缺失时产生了显著效应。重要的是，乳腺上皮中Runx表达的改变还驱动了肿瘤微环境的深刻变化，影响了免疫景观，揭示了Runx基因缺失在乳腺组织中的外在效应。

组织，小鼠模型：9周龄乳腺的细胞制备来自以下基因型的雌性小鼠：1) BLG-Cre;Catnbwt/lox(ex3) 2) BLG-Cre;Catnbwt/lox(ex3);Runx1fl/fl 3) BLG-Cre;Catnbwt/lox(ex3);Runx2fl/fl 4) BLG-Cre;Catnbwt/lox(ex3); Runx1fl/fl;Runx2fl/fl

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别