PRJEB122585：雌激素受体阳性乳腺癌肠道微生物组成与代谢通路——病例对照研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB122585

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管在诊断和治疗方面取得了进展，乳腺癌仍是加拿大女性中最常见的癌症，也是癌症相关死亡的第二大原因。减少乳腺癌负担的新方法对改善公共卫生至关重要。雌激素是已知的最常见乳腺癌类型（HR阳性）的致病因素。肠道中的细菌可调控雌激素水平。这些细菌类型或数量的变化会升高雌激素水平，且在动物模型中可导致癌症发生。然而，人体研究非常有限。为了解雌激素相关肠道细菌是否在乳腺癌发生中起作用，我们开展了一项研究，纳入70名新诊断的HR阳性乳腺癌女性和70名无癌症女性（对照）。参与者将被要求填写关于膳食摄入和健康因素的问卷，并在接受激素治疗前后提供粪便样本；对照参与者则在相同时间段内提供粪便样本。采用全宏基因组鸟枪法测序测定细菌的类型和数量。在血液和粪便中测定代谢物。比较了患乳腺癌与未患乳腺癌女性之间细菌和代谢物的类型及数量差异。这些结果将为了解微生物组如何可能促进乳腺癌发生提供新知识，并可能促成减轻乳腺癌对女性及其家庭负担的新方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。