基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJEB115736：S6K1与S6K2在HR DNA修复中的功能研究

PRJEB115736 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目，其英文名称为“Study of S6K1 and S6K2 functions in HR DNA repair”，中文可理解为关于 S6K1 与 S6K2 在 HR DNA 修复中功能的研究。该项目在源站上的标题为“S6K1 and S6K2 regulate homologous recombination DN... (ID 1505859) - BioProject - NCBI”，本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向，主题标签为 Other。整体来看，该数据集围绕 S6K1 和 S6K2 两个分子在同源重组（HR）DNA 修复过程中的作用展开，属于生物医学基础研究范畴，尤其与肿瘤和乳腺癌方向存在分类上的关联。BioProject 作为生物数据的集合记录，为该项目所生成的不同类型数据提供统一的查找入口。

【数据集背景】

该数据集对应的项目为 PRJEB115736，其研究主题聚焦于 S6K1 与 S6K2 在 HR DNA 修复中的功能。同源重组是 DNA 双链断裂修复的重要途径之一，而 S6K1 和 S6K2 作为相关分子，其在该修复过程中的调控作用构成了本项目的核心研究问题。本站将该数据集归类于肿瘤 / 乳腺癌方向，说明该研究可能与肿瘤生物学或乳腺癌相关领域存在关联。源站标题进一步表明，S6K1 和 S6K2 对同源重组 DNA 修复具有调控作用。该项目的主题标签为 Other，表明其在源站的主题分类中未被归入更具体的既定类别。

【数据内容】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 PRJEB115736 项目。BioProject 记录本身是生物数据的集合，旨在为用户提供一个统一的位置，以查找为某一项目生成的不同数据类型。因此，该数据集的内容涵盖与 S6K1 和 S6K2 在 HR DNA 修复中功能研究相关的各类生物数据。关于该项目具体包含哪些数据类型、样本数量、测序平台或分析结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）网站。项目以 BioProject 形式收录，编号为 PRJEB115736。源站描述指出，BioProject 是源自单一组织或联盟、与单一研究计划相关的生物数据集合，其记录为用户提供查找该项目所生成多种数据类型的统一入口。关于该项目的具体采集方法、实验设计、样本来源或数据处理流程，源站未提供。

【适用场景】

基于该数据集的主题，其潜在适用场景包括：同源重组 DNA 修复机制研究、S6K1 与 S6K2 功能研究，以及肿瘤 / 乳腺癌相关的基础生物学研究。由于本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向，该数据集可能适用于探索 DNA 修复与肿瘤发生发展之间关系的研究场景。关于该数据集在具体研究中的适用性验证或推荐用途，源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI BioProject 平台提供访问，用户可通过 BioProject 记录查找为该项目生成的不同数据类型。关于具体的数据下载方式、分析工具、使用步骤或操作指南，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的项目记录，其数据质量与完整性依赖于源站的管理与收录标准。由于源站描述仅对 BioProject 的性质作出一般性说明，未针对该项目提供具体的质量评估、数据验证结果或已知限制。关于该数据集在数据覆盖度、准确性或使用限制方面的具体信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJEB115736。关于该数据集的引用格式、许可条款或使用授权信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB115736

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB115736

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

近期研究表明，S6激酶1（S6K1）参与DNA修复。然而，关于这一调控所涉及的具体通路和机制的问题仍未得到解答。此外，S6K1的功能同源物S6K2是否也参与DNA修复，尚未被研究。在此，我们证明S6K1和S6K2（S6K1/2）对高效的同源重组（HR）DNA修复均至关重要。S6K1/2双敲除阻止了BRCA1和RAD51聚焦点的形成，增加了对DNA损伤的敏感性，并增加了基因组不稳定的标志物，而单敲除对HR标志物影响甚微。我们的研究结果表明，S6K1/2在调控HR方面具有重叠和代偿功能。在机制上，我们证明S6K1/2对维持BRCA1蛋白稳定性、限制其蛋白酶体降解并促进基因组稳定性至关重要。最后，S6K1/2的药理学抑制使HR功能正常的乳腺癌细胞对奥拉帕利敏感，凸显了一种增强PARP1抑制剂在HR功能正常肿瘤中疗效的潜在治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别